RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491889.5

GLIS3-217, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GLIS3, Length 797 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-217ENST00000491889 FGRP09769 529 aa24.4■■□□□ 1.5
GLIS3-217ENST00000491889 HMGCS2P54868 508 aa24.4■■□□□ 1.5
GLIS3-217ENST00000491889 DGKZQ13574 1117 aa24.4■■□□□ 1.5
GLIS3-217ENST00000491889 SH3D19Q5HYK7 790 aa24.4■■□□□ 1.5
GLIS3-217ENST00000491889 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
GLIS3-217ENST00000491889 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.4■■□□□ 1.5
GLIS3-217ENST00000491889 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.4■■□□□ 1.5
GLIS3-217ENST00000491889 USP17L10C9JJH3 530 aa24.39■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 ZNF213O14771 459 aa24.39■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 ORC4O43929 436 aa24.39■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 GPAT2Q6NUI2 795 aa24.39■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 CASC1Q6TDU7 716 aa24.39■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 ANKRD23Q86SG2 305 aa24.39■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.39■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 MYH4Q9Y623 1939 aa24.39■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 C19orf81C9J6K1 198 aa24.38■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 ICA1Q05084 483 aa24.38■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.38■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 SIAH1Q8IUQ4 282 aa24.38■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 STAG1Q8WVM7 1258 aa24.38■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 FEZ1Q99689 392 aa24.38■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 CFHR5Q9BXR6 569 aa24.38■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 KANSL2Q9H9L4 492 aa24.38■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.37■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 A0A1W2PRG0 241 aa24.37■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 TBC1D8O95759 1140 aa24.37■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.37■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.37■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.37■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 MAP4K1Q92918 833 aa24.37■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.37■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa24.37■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 PDHXO00330 501 aa24.36■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 TSPY3P0CV98 308 aa24.36■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 TSPY8P0CW00 308 aa24.36■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 TFAP4Q01664 338 aa24.36■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 TREML2Q5T2D2 321 aa24.36■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa24.36■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.36■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.36■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 CRHR2Q13324 411 aa24.35■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.35■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.35■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 C12orf42Q96LP6 360 aa24.35■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.35■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.35■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 TOMM22Q9NS69 142 aa24.35■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 NEDD4P46934 1319 aa24.35■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 TSPY2A6NKD2 308 aa24.34■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 USP14P54578 494 aa24.34■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 CEP95Q96GE4 821 aa24.34■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa24.34■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa24.33■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 CYP21A2P08686 494 aa24.33■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 LBX1P52954 281 aa24.33■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 ATP2B2Q01814 1243 aa24.33■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.33■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 TMX2Q9Y320 296 aa24.33■■□□□ 1.49
GLIS3-217ENST00000491889 SH2D4AQ9H788 454 aa24.32■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.32■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 MTMR4Q9NYA4 1195 aa24.32■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 NYAP2Q9P242 653 aa24.32■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 NMT2O60551 498 aa24.3■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 CYP2C8P10632 490 aa24.3■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 VCAM1P19320 739 aa24.3■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa24.3■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 VCPKMTQ9H867 229 aa24.3■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 IL17RBQ9NRM6 502 aa24.3■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 TAF6LQ9Y6J9 622 aa24.3■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 ADGRA2Q96PE1 1338 aa24.3■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 B4E1Z4 1266 aa24.29■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 GPR25O00155 361 aa24.29■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 TTLL1O95922 423 aa24.29■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 ESR2Q92731 530 aa24.29■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.29■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 PNMA3Q9UL41 463 aa24.29■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 TLR2O60603 784 aa24.28■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.28■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 PARP14Q460N5 1801 aa24.28■■□□□ 1.48
GLIS3-217ENST00000491889 KDM4AO75164 1064 aa24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms