RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491706.5

MEIS1-211, Transcript of Meis homeobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene MEIS1, Length 1,900 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1-211ENST00000491706 CABP5Q9NP86 173 aa10.72□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa10.72□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 CEP131Q9UPN4 1083 aa10.72□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa10.72□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 USP17L12C9JPN9 530 aa10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 USP17L21D6R901 530 aa10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 FOXN1O15353 648 aa10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 CTIFO43310 598 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 PLEKHA8P1O95397 391 aa10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 ATP1A3P13637 1013 aa10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 XBP1P17861 261 aa10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 ATP2B1P20020 1258 aa10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 VPS72Q15906 364 aa10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 ARMCX5Q6P1M9 558 aa10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 IQCA1Q86XH1 822 aa10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 KCND1Q9NSA2 647 aa10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 VPS54Q9P1Q0 977 aa10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa10.71□□□□□ -0.69
MEIS1-211ENST00000491706 TAF1P21675 1872 aa10.71□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 GNPATO15228 680 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 ZPR1O75312 459 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 CALM1P0DP23 149 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 CALM2P0DP24 149 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 CALM3P0DP25 149 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 KRT2P35908 639 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 TROAPQ12815 778 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 CEP135Q66GS9 1140 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 NYAP1Q6ZVC0 841 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 CCDC24Q8N4L8 307 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 KCTD17Q8N5Z5 321 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 PHF20Q9BVI0 1012 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 SERTAD1Q9UHV2 236 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 V9GY48 417 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 FAM205CA6NFA0 338 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 TRIM75PA6NK02 468 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 CBFA2T2O43439 604 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 MYO1BO43795 1136 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 ORC4O43929 436 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 DDAH1O94760 285 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 BMP6P22004 513 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 EVX2Q03828 476 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 POSTNQ15063 836 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 TMTC3Q6ZXV5 915 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 MAN1B1Q9UKM7 699 aa10.7□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 CYP2D6P10635 497 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 UBASH3AP57075 661 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 PDE4BQ07343 736 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 PTPN14Q15678 1187 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 NT5DC1Q5TFE4 455 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 TPTE2Q6XPS3 522 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 DPF2Q92785 391 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 CSRNP2Q9H175 543 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 CASZ1Q86V15 1759 aa10.69□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 RAD21O60216 631 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 SERPINC1P01008 464 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 PRDX5P30044 214 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 TM4SF1P30408 202 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 SARSP49591 514 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 FAM47AQ5JRC9 791 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 USP49Q70CQ1 688 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 CCDC112Q8NEF3 446 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 ZNF592Q92610 1267 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 SMARCE1Q969G3 411 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 FANCLQ9NW38 375 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 COL24A1Q17RW2 1714 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 NMT2O60551 498 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 MORC3Q14149 939 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 SBK1Q52WX2 424 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 KANK3Q6NY19 840 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 TXNRD3Q86VQ6 643 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 PDILTQ8N807 584 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 ANKRD7Q92527 254 aa10.68□□□□□ -0.7
MEIS1-211ENST00000491706 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms