RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484874.2

CNKSR1-208, Transcript of connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

TSL 3

Gene CNKSR1, Length 642 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1-208ENST00000484874 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.5■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.5■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.5■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.5■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 PDHXO00330 501 aa21.49■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 ZNF213O14771 459 aa21.49■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 ORC4O43929 436 aa21.49■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 NT5C2P49902 561 aa21.49■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 HMGCS2P54868 508 aa21.49■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 CTDSPL2Q05D32 466 aa21.49■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 GADL1Q6ZQY3 521 aa21.49■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.49■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 C12orf42Q96LP6 360 aa21.49■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 TMOD4Q9NZQ9 345 aa21.49■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 CRHR2Q13324 411 aa21.48■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 MTMR2Q13614 643 aa21.48■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.48■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 ACER1Q8TDN7 264 aa21.48■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 EMILIN3Q9NT22 766 aa21.48■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 TSKSQ9UJT2 592 aa21.48■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 PTPRFP10586 1907 aa21.48■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 MYH8P13535 1937 aa21.48■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 GPR25O00155 361 aa21.47■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 PRDM1O75626 825 aa21.47■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 MAP4K1Q92918 833 aa21.47■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.47■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.47■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.47■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 NYAP2Q9P242 653 aa21.47■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 TMX2Q9Y320 296 aa21.47■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.46■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 A0A1W2PRG0 241 aa21.46■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 TLR2O60603 784 aa21.46■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 TFAP4Q01664 338 aa21.46■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 ICA1Q05084 483 aa21.46■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.46■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 CASC1Q6TDU7 716 aa21.46■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.46■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 SH2D4AQ9H788 454 aa21.46■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.46■■□□□ 1.03
CNKSR1-208ENST00000484874 CDC45O75419 566 aa21.45■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 PTH1RQ03431 593 aa21.45■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.45■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.45■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.45■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 MKL1Q969V6 931 aa21.45■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 INCENPQ9NQS7 918 aa21.45■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 TSPY3P0CV98 308 aa21.44■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 TSPY8P0CW00 308 aa21.44■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 HAND2P61296 217 aa21.44■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 TREML2Q5T2D2 321 aa21.44■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 FEZ1Q99689 392 aa21.44■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 NBPF3Q9H094 633 aa21.44■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 MTMR4Q9NYA4 1195 aa21.44■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 PNMA3Q9UL41 463 aa21.44■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.44■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.44■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 OSBPP22059 807 aa21.43■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 FAM47AQ5JRC9 791 aa21.43■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 C17orf99Q6UX52 265 aa21.43■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 LPAR1Q92633 364 aa21.43■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa21.43■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 TSPY2A6NKD2 308 aa21.42■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 FKTNO75072 461 aa21.42■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 NOVP48745 357 aa21.42■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 DGKZQ13574 1117 aa21.42■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 VCPKMTQ9H867 229 aa21.42■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 LOC285556D6RIA3 1793 aa21.41■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 ADGRA2Q96PE1 1338 aa21.41■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 USP17L15C9J2P7 530 aa21.41■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 USP17L13C9JLJ4 530 aa21.41■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 USP17L11C9JVI0 530 aa21.41■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 USP17L18D6R9N7 530 aa21.41■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 USP17L22D6RA61 530 aa21.41■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 USP17L17D6RBQ6 530 aa21.41■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 USP17L19D6RCP7 530 aa21.41■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 USP17L20D6RJB6 530 aa21.41■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 TTLL1O95922 423 aa21.41■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 SP3Q02447 781 aa21.41■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 USP17L24Q0WX57 530 aa21.41■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.41■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 CEP95Q96GE4 821 aa21.41■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.41■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 CYP2C8P10632 490 aa21.4■■□□□ 1.02
CNKSR1-208ENST00000484874 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms