RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484657.5

GTPBP1-209, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 4

Gene GTPBP1, Length 585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-209	ENST00000484657	USP17L18	D6R9N7	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	USP17L22	D6RA61	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	USP17L19	D6RCP7	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	USP17L20	D6RJB6	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	PEX10	O60683	326 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	COL6A1	P12109	1028 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	CYP2B6	P20813	491 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	RGS2	P41220	211 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	USP14	P54578	494 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	GABPA	Q06546	454 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	USP17L24	Q0WX57	530 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		13.75	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	PFAS	O15067	1338 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	CNMD	O75829	334 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	VCAM1	P19320	739 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	SHMT1	P34896	483 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	USP5	P45974	858 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	GPR153	Q6NV75	609 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	HOXC6	P09630	235 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	CCNA1	P78396	465 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	MAP2K5	Q13163	448 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	LHX8	Q68G74	356 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	AACS	Q86V21	672 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	FEZ1	Q99689	392 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	STAP2	Q9UGK3	403 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	IGHA2	P01877	340 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	PLCD1	P51178	756 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	CCL14	Q16627	93 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	ACER1	Q8TDN7	264 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	CABP5	Q9NP86	173 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	LTBP2	Q14767	1821 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	PDE6A	P16499	860 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	PTPRE	P23469	700 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	GRB14	Q14449	540 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTPBP1-209	ENST00000484657	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	MIER1	Q8N108	512 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	LRCH3	Q96II8	777 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	BTBD7	Q9P203	1132 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657		A0A0C4DFX4	3053 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	MSC	O60682	206 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	MS4A1	P11836	297 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	SEPT2	Q15019	361 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	PANK1	Q8TE04	598 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		13.69	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657		A0A1W2PRG0	241 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	TDH	Q8IZJ6	230 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GTPBP1-209	ENST00000484657	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.68	□□□□□ -0.22

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