RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484101.5

UFD1-208, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, human

TSL 5

Gene UFD1, Length 751 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UFD1-208	ENST00000484101	TGFB2	P61812	414 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	TROAP	Q12815	778 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	SLC39A14	Q15043	492 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	PODN	Q7Z5L7	613 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	TEX11	Q8IYF3	940 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	MRI	Q9BWK5	157 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	KAT14	Q9H8E8	782 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	SENP2	Q9HC62	589 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	RNF181	Q9P0P0	153 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	CMA1	P23946	247 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	FOSB	P53539	338 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	GUCY1B3	Q02153	619 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	FSIP1	Q8NA03	581 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	PHKB	Q93100	1093 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	TIGD1	Q96MW7	591 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	MYL10	Q9BUA6	226 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	INCENP	Q9NQS7	918 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	WBP1L	Q9NX94	342 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	CNTNAP1	P78357	1384 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	FLT1	P17948	1338 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101		G3V3G9	751 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	NR1I2	O75469	434 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	TSPY3	P0CV98	308 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	TSPY8	P0CW00	308 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	RXRA	P19793	462 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	CALML3	P27482	149 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	TYRO3	Q06418	890 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	GALNT17	Q6IS24	598 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	SWAP70	Q9UH65	585 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	SBF1	O95248	1867 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	KIF28P	B7ZC32	967 aa		11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	CUTA	O60888	179 aa		11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	TPM3	P06753	285 aa		11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	USP17L8	P0C7I0	530 aa		11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	SMARCA1	P28370	1054 aa		11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	KRT2	P35908	639 aa		11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	TRAPPC10	P48553	1259 aa		11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	RHBDL3	P58872	404 aa		11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	TFAP4	Q01664	338 aa		11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	FUT2	Q10981	343 aa		11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	GRM4	Q14833	912 aa		11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	STX1A	Q16623	288 aa		11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	TEKT1	Q969V4	418 aa		11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	SNED1	Q8TER0	1413 aa		11.09	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		11.08	□□□□□ -0.64
UFD1-208	ENST00000484101	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
UFD1-208	ENST00000484101	SLX4	Q8IY92	1834 aa		11.08	□□□□□ -0.64
UFD1-208	ENST00000484101	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		11.08	□□□□□ -0.64
UFD1-208	ENST00000484101	DTNB	O60941	627 aa		11.08	□□□□□ -0.64
UFD1-208	ENST00000484101	PRDM1	O75626	825 aa		11.08	□□□□□ -0.64
UFD1-208	ENST00000484101	HLA-DOA	P06340	250 aa		11.08	□□□□□ -0.64
UFD1-208	ENST00000484101	DPEP1	P16444	411 aa		11.08	□□□□□ -0.64
UFD1-208	ENST00000484101	GTF2I	P78347	998 aa		11.08	□□□□□ -0.64
UFD1-208	ENST00000484101	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
UFD1-208	ENST00000484101	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
UFD1-208	ENST00000484101	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 153.7 ms