RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478538.1

ITGB3BP-211, Transcript of integrin subunit beta 3 binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB3BP, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BP-211ENST00000478538 TMEM130Q8N3G9 435 aa5.92□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa5.92□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 ISL2Q96A47 359 aa5.92□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 SEMA6BQ9H3T3 888 aa5.92□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 KANSL2Q9H9L4 492 aa5.92□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 TMEM260Q9NX78 707 aa5.92□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP5.92□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 ACTL7BQ9Y614 415 aa5.92□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa5.92□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 RGS13O14921 159 aa5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 SUSD5O60279 629 aa5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 CDC45O75419 566 aa5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 UBOX5O94941 541 aa5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 CST3P01034 146 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 CHRNA4P43681 627 aa5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 PRRT3Q5FWE3 981 aa5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 PHACTR4Q8IZ21 702 aa5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 PIDD1Q9HB75 910 aa5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 FAM105AQ9NUU6 356 aa5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZMYM5Q9UJ78 669 aa5.91□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 FAM86C2PA6NEL3 165 aa5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 DRD2P14416 443 aa5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 PMS1P54277 932 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 SLC7A5Q01650 507 aa5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 SQSTM1Q13501 440 aa5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 SLC10A6Q3KNW5 377 aa5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 SPATC1Q76KD6 591 aa5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 DYMQ7RTS9 669 aa5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 CD163Q86VB7 1156 aa5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 PPFIBP1Q86W92 1011 aa5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 APPBP2Q92624 585 aa5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 CCDC74BQ96LY2 380 aa5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 SLC6A18Q96N87 628 aa5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 KIF2CQ99661 725 aa5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 EPN3Q9H201 632 aa5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 FANCLQ9NW38 375 aa5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 PCDHB10Q9UN67 800 aa5.9□□□□□ -1.46
ITGB3BP-211ENST00000478538 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 SCO2A0A1W2PP80 73 aa5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 ESYT3A0FGR9 886 aa5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 LRIG2O94898 1065 aa5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 ASPAP45381 313 aa5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 PREPP48147 710 aa5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 DOC2BQ14184 412 aa5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 BBS9Q3SYG4 887 aa5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 KIAA1211LQ6NV74 962 aa5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 SHISA2Q6UWI4 295 aa5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 CDC37L1Q7L3B6 337 aa5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 HOMER1Q86YM7 354 aa5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 TMEM192Q8IY95 271 aa5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 PFDN2Q9UHV9 154 aa5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 KDM2BQ8NHM5 1336 aa5.89□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 CLSTN1O94985 981 aa5.88□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 CHMP4BP1P59074 171 aa5.88□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 GNPTABQ3T906 1256 aa5.88□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 ARMCX6Q7L4S7 300 aa5.88□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 DHRS1Q96LJ7 313 aa5.88□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 CEP41Q9BYV8 373 aa5.88□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 FOXQ1Q9C009 403 aa5.88□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 ACSS3Q9H6R3 686 aa5.88□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 AKTIPQ9H8T0 292 aa5.88□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 LEMD3Q9Y2U8 911 aa5.88□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 CLEC3AO75596 197 aa5.87□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 GRIK4Q16099 956 aa5.87□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 MFSD2AQ8NA29 543 aa5.87□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 DNAJB8Q8NHS0 232 aa5.87□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa5.87□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP5.87□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa5.87□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 C9IYK1 514 aa5.86□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 CBFA2T2O43439 604 aa5.86□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 ADCY3O60266 1144 aa5.86□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 ALX3O95076 343 aa5.86□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 NAT2P11245 290 aa5.86□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 RAB6AP20340 208 aa5.86□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 GBP1P32455 592 aa5.86□□□□□ -1.47
ITGB3BP-211ENST00000478538 LONRF2Q1L5Z9 754 aa5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms