RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477440.6

ARHGEF3-208, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-208ENST00000477440 CLEC10AQ8IUN9 316 aa30.29■■■□□ 2.44
ARHGEF3-208ENST00000477440 CCDC17Q96LX7 622 aa30.29■■■□□ 2.44
ARHGEF3-208ENST00000477440 FEZ1Q99689 392 aa30.29■■■□□ 2.44
ARHGEF3-208ENST00000477440 TMOD4Q9NZQ9 345 aa30.29■■■□□ 2.44
ARHGEF3-208ENST00000477440 CCDC171Q6TFL3 1326 aa30.28■■■□□ 2.44
ARHGEF3-208ENST00000477440 NEFLP07196 543 aa30.28■■■□□ 2.44
ARHGEF3-208ENST00000477440 ERO1AQ96HE7 468 aa30.28■■■□□ 2.44
ARHGEF3-208ENST00000477440 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa30.28■■■□□ 2.44
ARHGEF3-208ENST00000477440 EMILIN3Q9NT22 766 aa30.28■■■□□ 2.44
ARHGEF3-208ENST00000477440 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
ARHGEF3-208ENST00000477440 RASA1P20936 1047 aa30.27■■■□□ 2.44
ARHGEF3-208ENST00000477440 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
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ARHGEF3-208ENST00000477440 PPARAQ07869 468 aa30.26■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 USP17L2Q6R6M4 530 aa30.26■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 SKAP1Q86WV1 359 aa30.26■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa30.26■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 A0A1W2PRG0 241 aa30.25■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 HIP1O00291 1037 aa30.25■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 MKNK2Q9HBH9 465 aa30.25■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 PNMA3Q9UL41 463 aa30.25■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 PRDM1O75626 825 aa30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 BCRP11274 1271 aa30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 ICA1Q05084 483 aa30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 CCDC136Q96JN2 1154 aa30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 C12orf42Q96LP6 360 aa30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 TRIM17Q9Y577 477 aa30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 HTTP42858 3142 aa30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 USP14P54578 494 aa30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 ALX1Q15699 326 aa30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 OTOP1Q7RTM1 612 aa30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 SIAH1Q8IUQ4 282 aa30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 ABHD8Q96I13 439 aa30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 LAMA4Q16363 1823 aa30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 MYH4Q9Y623 1939 aa30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa30.22■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 FGAP02671 866 aa30.21■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 OSBPP22059 807 aa30.21■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
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ARHGEF3-208ENST00000477440 CTDSPL2Q05D32 466 aa30.21■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZMYM6O95789 1325 aa30.21■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 VCAM1P19320 739 aa30.2■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 IL25Q9H293 177 aa30.2■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 EFCC1Q9HA90 598 aa30.2■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZNF287Q9HBT7 754 aa30.2■■■□□ 2.43
ARHGEF3-208ENST00000477440 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa30.2■■■□□ 2.43
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ARHGEF3-208ENST00000477440 CTGFP29279 349 aa30.19■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 PDE4BQ07343 736 aa30.19■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
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ARHGEF3-208ENST00000477440 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa30.18■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 ANAPC4Q9UJX5 808 aa30.18■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP30.18■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 TMX2Q9Y320 296 aa30.18■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 TACC3Q9Y6A5 838 aa30.18■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 ATP2B2Q01814 1243 aa30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 KIF22Q14807 665 aa30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 IFFO2Q5TF58 517 aa30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
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ARHGEF3-208ENST00000477440 INCENPQ9NQS7 918 aa30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 PARP14Q460N5 1801 aa30.17■■■□□ 2.42
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ARHGEF3-208ENST00000477440 PLIN4Q96Q06 1357 aa30.15■■■□□ 2.42
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ARHGEF3-208ENST00000477440 CHMLP26374 656 aa30.15■■■□□ 2.42
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ARHGEF3-208ENST00000477440 HERVK_113P62684 666 aa30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 FAM47AQ5JRC9 791 aa30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 TRIM47Q96LD4 638 aa30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 DOCK3Q8IZD9 2030 aa30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 USP17L15C9J2P7 530 aa30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 USP17L13C9JLJ4 530 aa30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 USP17L11C9JVI0 530 aa30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 USP17L18D6R9N7 530 aa30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 USP17L22D6RA61 530 aa30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 USP17L17D6RBQ6 530 aa30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 USP17L19D6RCP7 530 aa30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 USP17L20D6RJB6 530 aa30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 CAPN15O75808 1086 aa30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 PSMC4P43686 418 aa30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 HAND2P61296 217 aa30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 USP17L24Q0WX57 530 aa30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 FAM110CQ1W6H9 321 aa30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF3-208ENST00000477440 VCPKMTQ9H867 229 aa30.14■■■□□ 2.42
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