RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460331.5

ZNF3-211, Transcript of zinc finger protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF3, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3-211ENST00000460331 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
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ZNF3-211ENST00000460331 SNX21Q969T3 373 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 CEP95Q96GE4 821 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.63□□□□□ -0.07
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ZNF3-211ENST00000460331 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.62□□□□□ -0.07
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ZNF3-211ENST00000460331 SH2D4AQ9H788 454 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 LY9Q9HBG7 655 aa14.62□□□□□ -0.07
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ZNF3-211ENST00000460331 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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ZNF3-211ENST00000460331 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.61□□□□□ -0.07
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ZNF3-211ENST00000460331 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF3-211ENST00000460331 C19orf81C9J6K1 198 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF3-211ENST00000460331 USP17L10C9JJH3 530 aa14.57□□□□□ -0.08
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ZNF3-211ENST00000460331 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ZNF3-211ENST00000460331 KIF5BP33176 963 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF3-211ENST00000460331 USP14P54578 494 aa14.57□□□□□ -0.08
ZNF3-211ENST00000460331 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ZNF3-211ENST00000460331 MOB2Q70IA6 237 aa14.57□□□□□ -0.08
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