RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa10.29□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 C20orf194Q5TEA3 1177 aa10.29□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHRDL2Q6WN34 429 aa10.29□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 LCORLQ8N3X6 602 aa10.29□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 ACER1Q8TDN7 264 aa10.29□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIF1BPQ96EK5 621 aa10.29□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP10.29□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 SERPINB13Q9UIV8 391 aa10.29□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 DDX19BQ9UMR2 479 aa10.29□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF532Q9HCE3 1301 aa10.29□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRRC37A2A6NM11 1700 aa10.28□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 HMGCRP04035 888 aa10.28□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP5P45974 858 aa10.28□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 ERVK-9P63128 1117 aa10.28□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 ERVK-24P63145 666 aa10.28□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 CERS3Q8IU89 383 aa10.28□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 SDR42E1Q8WUS8 393 aa10.28□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMOD4Q9NZQ9 345 aa10.28□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAOK2Q9UL54 1235 aa10.28□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 GBF1Q92538 1859 aa10.27□□□□□ -0.76
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1W2PRG0 241 aa10.27□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 APBB1O00213 710 aa10.27□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 GOLIM4O00461 696 aa10.27□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYP2D6P10635 497 aa10.27□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 VCAM1P19320 739 aa10.27□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADD2P35612 726 aa10.27□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCL14Q16627 93 aa10.27□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa10.27□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa10.27□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 MORN1Q5T089 497 aa10.27□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP17L2Q6R6M4 530 aa10.27□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC44A5Q8NCS7 719 aa10.27□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa10.27□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 LAMA4Q16363 1823 aa10.27□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPTORQ8N122 1335 aa10.27□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa10.26□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRKAB2O43741 272 aa10.26□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGHA2P01877 340 aa10.26□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYP2B6P20813 491 aa10.26□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 SEPT2Q15019 361 aa10.26□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 ABCB5Q2M3G0 1257 aa10.26□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa10.26□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 LBX2Q6XYB7 198 aa10.26□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa10.26□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR142Q7Z601 462 aa10.26□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 TTC6Q86TZ1 520 aa10.26□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLEC10AQ8IUN9 316 aa10.26□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa10.26□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 DPF3Q92784 378 aa10.26□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 PAGR1Q9BTK6 254 aa10.26□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIM34Q9BYJ4 488 aa10.26□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARMT1Q9H993 441 aa10.26□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 BTBD7Q9P203 1132 aa10.26□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 RCAN3Q9UKA8 241 aa10.26□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB11FIP3O75154 756 aa10.25□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 MS4A1P11836 297 aa10.25□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATP5JP18859 108 aa10.25□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB3GAP1Q15042 981 aa10.25□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 SIAH1Q8IUQ4 282 aa10.25□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 SOCS4Q8WXH5 440 aa10.25□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 DYNLL2Q96FJ2 89 aa10.25□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 NUDT12Q9BQG2 462 aa10.25□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 HTATIP2Q9BUP3 242 aa10.25□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 BOLA2Q9H3K6 86 aa10.25□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 PAG1Q9NWQ8 432 aa10.25□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 MCM9Q9NXL9 1143 aa10.25□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 FLRT1Q9NZU1 646 aa10.25□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 OGDHLQ9ULD0 1010 aa10.25□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 COL6A3P12111 3177 aa10.25□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 PFASO15067 1338 aa10.25□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa10.24□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP17L15C9J2P7 530 aa10.24□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP17L13C9JLJ4 530 aa10.24□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP17L11C9JVI0 530 aa10.24□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP17L18D6R9N7 530 aa10.24□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP17L22D6RA61 530 aa10.24□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP17L17D6RBQ6 530 aa10.24□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP17L19D6RCP7 530 aa10.24□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP17L20D6RJB6 530 aa10.24□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 HMMRO75330 724 aa10.24□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 MBD4O95243 580 aa10.24□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 TFRCP02786 760 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
GAPDHP28-201ENST00000455134 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms