RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441692.5

THOC2-208, Transcript of THO complex 2, human

TSL 5

Gene THOC2, Length 4,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
THOC2-208	ENST00000441692	GTF3C6	Q969F1	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	OPTN	Q96CV9	577 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	FAM161B	Q96MY7	647 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	TSPY26P	Q9H489	355 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	PAPPA	Q13219	1627 aa		4.63	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692		A0A087WWV3	80 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	WNT10B	O00744	389 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	PHKA1	P46020	1223 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	MAP3K9	P80192	1104 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	SPRYD7	Q5W111	196 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	C4A	P0C0L4	1744 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	YDJC	A8MPS7	323 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	CIAO1	O76071	339 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	FGA	P02671	866 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	CACNB3	P54284	484 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	FCGRT	P55899	365 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	UBE2H	P62256	183 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	USP25	Q9UHP3	1055 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	ITGB4	P16144	1822 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	RXRA	P19793	462 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	PLCB2	Q00722	1185 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	ATP2B2	Q01814	1243 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	SLC51A	Q86UW1	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	SENP2	Q9HC62	589 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	RAI14	Q9P0K7	980 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	TTC28	Q96AY4	2481 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	GRK4	P32298	578 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67	7e-8	■■□□□ 13.4
THOC2-208	ENST00000441692	CRHR2	Q13324	411 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	SLF2	Q8IX21	1173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	PGBD1	Q96JS3	809 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	GPR108	Q9NPR9	543 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	MCM5	P33992	734 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	NBPF3	Q9H094	633 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	TRIM75P	A6NK02	468 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	GPAA1	O43292	621 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	SLC5A1	P13866	664 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	CHRND	Q07001	517 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	IFNL1	Q8IU54	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	WNK4	Q96J92	1243 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	DEFB118	Q96PH6	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	CD209	Q9NNX6	404 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	COL4A1	P02462	1669 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	NR1I2	O75469	434 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	ANTXR2	P58335	489 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	CHMP4BP1	P59074	171 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	KRT32	Q14532	448 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	CCDC102B	Q68D86	513 aa		4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
THOC2-208	ENST00000441692	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67

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