RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 USP17L15C9J2P7 530 aa23.57■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.57■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 USP17L11C9JVI0 530 aa23.57■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 USP17L18D6R9N7 530 aa23.57■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 USP17L22D6RA61 530 aa23.57■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.57■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 USP17L19D6RCP7 530 aa23.57■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 USP17L20D6RJB6 530 aa23.57■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 GJA8P48165 433 aa23.57■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 GABPAQ06546 454 aa23.57■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 USP17L24Q0WX57 530 aa23.57■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.57■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 DYNLL2Q96FJ2 89 aa23.57■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.57■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 SLC44A5Q8NCS7 719 aa23.56■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 SHISA4Q96DD7 197 aa23.56■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 C12orf42Q96LP6 360 aa23.56■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.56■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 SWAP70Q9UH65 585 aa23.56■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 VCAM1P19320 739 aa23.55■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 ERVK-9P63128 1117 aa23.55■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 ERVK-24P63145 666 aa23.55■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 GUCY1A2P33402 732 aa23.54■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.54■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.53■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 USP17L12C9JPN9 530 aa23.53■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 USP17L21D6R901 530 aa23.53■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 TFRCP02786 760 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 CYP2B6P20813 491 aa23.53■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 MAPK4P31152 587 aa23.53■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 Q3C1V9 767 aa23.53■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.53■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.53■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 DEFB118Q96PH6 123 aa23.53■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.53■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 GJD2Q9UKL4 321 aa23.53■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 SGPL1O95470 568 aa23.52■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 HMGCRP04035 888 aa23.52■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 WDR78Q5VTH9 848 aa23.52■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 DPF3Q92784 378 aa23.52■■□□□ 1.36
NPAS1-201ENST00000439365 C12orf60Q5U649 245 aa23.51■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.51■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 GCC1Q96CN9 775 aa23.51■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 PORCNQ9H237 461 aa23.51■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.51■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 AKR1B1P15121 316 aa23.5■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 CDK8P49336 464 aa23.5■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 CCNA1P78396 465 aa23.5■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 GPR142Q7Z601 462 aa23.5■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 SOCS4Q8WXH5 440 aa23.5■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.5■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 A0A1W2PRG0 241 aa23.49■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 ICA1Q05084 483 aa23.49■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 CTR9Q6PD62 1173 aa23.49■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 PLEKHH3Q7Z736 793 aa23.49■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.49■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 SMIM22K7EJ46 135 aa23.48■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 ERC2O15083 957 aa23.48■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 ATP2B2Q01814 1243 aa23.48■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 TRIM32Q13049 653 aa23.48■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.48■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.48■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 CCDC17Q96LX7 622 aa23.48■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 CRBNQ96SW2 442 aa23.48■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.48■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 SLC34A2O95436 690 aa23.47■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.47■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.47■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 TRIB2Q92519 343 aa23.47■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 APPBP2Q92624 585 aa23.47■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 HTATIP2Q9BUP3 242 aa23.47■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 SH2D4AQ9H788 454 aa23.47■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 TTC41PQ6P2S7 1318 aa23.46■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 MYH7P12883 1935 aa23.46■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 CNMDO75829 334 aa23.46■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 RGS2P41220 211 aa23.46■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.46■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 OSBP2Q969R2 916 aa23.46■■□□□ 1.35
NPAS1-201ENST00000439365 RPTORQ8N122 1335 aa23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms