RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432387.5

COPS7B-211, Transcript of COP9 signalosome subunit 7B, humanhuman

TSL 4

Gene COPS7B, Length 584 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7B-211ENST00000432387 RASA1P20936 1047 aa22.31■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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COPS7B-211ENST00000432387 PPARAQ07869 468 aa22.31■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 TREML2Q5T2D2 321 aa22.31■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.31■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 ACER1Q8TDN7 264 aa22.31■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 C12orf42Q96LP6 360 aa22.31■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.31■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 ZMYM6O95789 1325 aa22.31■■□□□ 1.16
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COPS7B-211ENST00000432387 CHMLP26374 656 aa22.3■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.3■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 A0A1W2PRG0 241 aa22.29■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 FGRP09769 529 aa22.29■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 USP14P54578 494 aa22.29■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
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COPS7B-211ENST00000432387 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.29■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 CYP2C8P10632 490 aa22.28■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 PDE4BQ07343 736 aa22.28■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 DGKZQ13574 1117 aa22.28■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.28■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.28■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 PNMA3Q9UL41 463 aa22.28■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 TMX2Q9Y320 296 aa22.28■■□□□ 1.16
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COPS7B-211ENST00000432387 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.27■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 ERO1AQ96HE7 468 aa22.27■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.27■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
COPS7B-211ENST00000432387 MYH8P13535 1937 aa22.26■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 BCRP11274 1271 aa22.26■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 OSBPP22059 807 aa22.26■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 TNS4Q8IZW8 715 aa22.26■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 IL25Q9H293 177 aa22.26■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.26■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.25■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.25■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 PRDM1O75626 825 aa22.25■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 ICA1Q05084 483 aa22.25■■□□□ 1.15
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COPS7B-211ENST00000432387 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.25■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 SKAP1Q86WV1 359 aa22.25■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.25■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 FEZ1Q99689 392 aa22.25■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.25■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 NYAP2Q9P242 653 aa22.25■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 CPA4Q9UI42 421 aa22.25■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 RAD50Q92878 1312 aa22.25■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 ORC4O43929 436 aa22.24■■□□□ 1.15
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COPS7B-211ENST00000432387 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.24■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 MKL1Q969V6 931 aa22.24■■□□□ 1.15
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COPS7B-211ENST00000432387 USP17L15C9J2P7 530 aa22.23■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.23■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 USP17L11C9JVI0 530 aa22.23■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 USP17L18D6R9N7 530 aa22.23■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 USP17L22D6RA61 530 aa22.23■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.23■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 USP17L19D6RCP7 530 aa22.23■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 USP17L20D6RJB6 530 aa22.23■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 CAP1Q01518 475 aa22.23■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 USP17L24Q0WX57 530 aa22.23■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 ARHGEF6Q15052 776 aa22.23■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.23■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 SH2D4AQ9H788 454 aa22.23■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 VCAM1P19320 739 aa22.22■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 TFAP4Q01664 338 aa22.22■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.22■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 LPAR1Q92633 364 aa22.22■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.22■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 VCPKMTQ9H867 229 aa22.22■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.22■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 ZNF213O14771 459 aa22.21■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 SGSM2O43147 1006 aa22.21■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.21■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.21■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.21■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.21■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.21■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.21■■□□□ 1.15
COPS7B-211ENST00000432387 TSPY3P0CV98 308 aa22.2■■□□□ 1.14
COPS7B-211ENST00000432387 TSPY8P0CW00 308 aa22.2■■□□□ 1.14
COPS7B-211ENST00000432387 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.2■■□□□ 1.14
COPS7B-211ENST00000432387 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.2■■□□□ 1.14
COPS7B-211ENST00000432387 NBPF3Q9H094 633 aa22.2■■□□□ 1.14
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