RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429160.1

UBXN7-205, Transcript of UBX domain protein 7, human

TSL 2

Gene UBXN7, Length 3,158 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN7-205	ENST00000429160	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	USP17L15	C9J2P7	530 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	USP17L11	C9JVI0	530 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	USP17L18	D6R9N7	530 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	USP17L22	D6RA61	530 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	USP17L19	D6RCP7	530 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	USP17L20	D6RJB6	530 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	CYP2D6	P10635	497 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	USP17L24	Q0WX57	530 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	FEZ1	Q99689	392 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	APP	P05067	770 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	HMGCS2	P54868	508 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	RILPL2	Q969X0	211 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	MYPN	Q86TC9	1320 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	NEFL	P07196	543 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	FCGRT	P55899	365 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	LBX2	Q6XYB7	198 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		13.11	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	PARP14	Q460N5	1801 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	JAG1	P78504	1218 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	GOPC	Q9HD26	462 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	NYAP2	Q9P242	653 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	MYH4	Q9Y623	1939 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	SLURP2	P0DP57	97 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	PPARA	Q07869	468 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	TMX2	Q9Y320	296 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	PDE4A	P27815	886 aa		13.09	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	ICA1	Q05084	483 aa		13.09	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	SEPT2	Q15019	361 aa		13.09	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	TREML2	Q5T2D2	321 aa		13.09	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		13.09	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		13.09	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		13.09	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	TRIM17	Q9Y577	477 aa		13.09	□□□□□ -0.31
UBXN7-205	ENST00000429160	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	ORC4	O43929	436 aa		13.08	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	CHGB	P05060	677 aa		13.08	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	AKR1B1	P15121	316 aa		13.08	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	RASA1	P20936	1047 aa		13.08	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.08	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		13.08	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		13.08	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		13.08	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	FGR	P09769	529 aa		13.08	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		13.08	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	CPA4	Q9UI42	421 aa		13.08	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		13.08	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160		A0A0D9SFI3	127 aa		13.08	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.08	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	MB21D1	Q8N884	522 aa		13.08	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	VCPKMT	Q9H867	229 aa		13.08	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		13.07	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		13.07	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	13.07	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		13.07	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	CCNA1	P78396	465 aa		13.07	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	MKL1	Q969V6	931 aa		13.07	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		13.06	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	CYP2C8	P10632	490 aa		13.06	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	VCAM1	P19320	739 aa		13.06	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	COPB2	P35606	906 aa		13.06	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	HERVK_113	P62684	666 aa		13.06	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	IRF5	Q13568	498 aa		13.06	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		13.06	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	ARMC5	Q96C12	935 aa		13.06	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM227B	Q96M60	508 aa		13.06	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		13.06	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	SRRD	Q9UH36	339 aa		13.06	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
UBXN7-205	ENST00000429160	MAPK4	P31152	587 aa		13.06	□□□□□ -0.32

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