RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 GRIN2BQ13224 1484 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRK-209ENST00000415046 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
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PTPRK-209ENST00000415046 SLC6A19Q695T7 634 aa7.27□□□□□ -1.25
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PTPRK-209ENST00000415046 PHC3Q8NDX5 983 aa7.27□□□□□ -1.25
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PTPRK-209ENST00000415046 TLR6Q9Y2C9 796 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTPRK-209ENST00000415046 CRELD1Q96HD1 420 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRK-209ENST00000415046 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRK-209ENST00000415046 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
PTPRK-209ENST00000415046 ERICH3Q5RHP9 1530 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRK-209ENST00000415046 SYNJ2O15056 1496 aa7.24□□□□□ -1.25
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PTPRK-209ENST00000415046 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
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PTPRK-209ENST00000415046 MESP2Q0VG99 397 aa7.22□□□□□ -1.25
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PTPRK-209ENST00000415046 SORBS3O60504 671 aa7.21□□□□□ -1.26
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PTPRK-209ENST00000415046 ZNF124Q15973 351 aa7.21□□□□□ -1.26
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PTPRK-209ENST00000415046 ZSWIM5Q9P217 1185 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-209ENST00000415046 CEP131Q9UPN4 1083 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-209ENST00000415046 GRIN2AQ12879 1464 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-209ENST00000415046 CLASP1Q7Z460 1538 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-209ENST00000415046 FHAD1B1AJZ9 1412 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRK-209ENST00000415046 BPNT1O95861 308 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRK-209ENST00000415046 GLI1P08151 1106 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRK-209ENST00000415046 PLCG1P19174 1290 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRK-209ENST00000415046 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRK-209ENST00000415046 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRK-209ENST00000415046 DBX1A6NMT0 343 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRK-209ENST00000415046 F6X3S4 739 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRK-209ENST00000415046 F13A1P00488 732 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRK-209ENST00000415046 PF4P02776 101 aa7.19□□□□□ -1.26
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