RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373436.5

RALGPS1-204, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 1,667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-204ENST00000373436 AGXT2Q9BYV1 514 aa23.48■■□□□ 1.35
RALGPS1-204ENST00000373436 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
RALGPS1-204ENST00000373436 ZSWIM5Q9P217 1185 aa23.48■■□□□ 1.35
RALGPS1-204ENST00000373436 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
RALGPS1-204ENST00000373436 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-204ENST00000373436 TSPY3P0CV98 308 aa23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-204ENST00000373436 TSPY8P0CW00 308 aa23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-204ENST00000373436 NT5C2P49902 561 aa23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-204ENST00000373436 ANTXR2P58335 489 aa23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-204ENST00000373436 JAG1P78504 1218 aa23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-204ENST00000373436 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-204ENST00000373436 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-204ENST00000373436 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RALGPS1-204ENST00000373436 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
RALGPS1-204ENST00000373436 NUCB2P80303 420 aa23.46■■□□□ 1.35
RALGPS1-204ENST00000373436 STK3Q13188 491 aa23.46■■□□□ 1.35
RALGPS1-204ENST00000373436 CYB5R4Q7L1T6 521 aa23.46■■□□□ 1.35
RALGPS1-204ENST00000373436 GH2P01242 217 aa23.45■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 FKBP1BP68106 108 aa23.45■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 APOBRQ0VD83 1088 aa23.45■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.45■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 NEDD1Q8NHV4 660 aa23.45■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 PLIN4Q96Q06 1357 aa23.45■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 WDR19Q8NEZ3 1342 aa23.45■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 MAP3K9P80192 1104 aa23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 PKP1Q13835 747 aa23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 CABP5Q9NP86 173 aa23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 VGLL4Q14135 290 aa23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 FBXL16Q8N461 479 aa23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.43■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 NMT2O60551 498 aa23.43■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 ASNSP08243 561 aa23.43■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 GUCY1A2P33402 732 aa23.43■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.43■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.43■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 IL17RBQ9NRM6 502 aa23.43■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 SEPT2Q15019 361 aa23.42■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 LDLRAD1Q5T700 205 aa23.42■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 IQCA1Q86XH1 822 aa23.42■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 CSADQ9Y600 493 aa23.42■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 GTF3C6Q969F1 213 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 CEP95Q96GE4 821 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 GINM1Q9NU53 330 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 DTNBO60941 627 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 UBAC1Q9BSL1 405 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 PICK1Q9NRD5 415 aa23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.4■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 MYH4Q9Y623 1939 aa23.4■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 PFKFB2O60825 505 aa23.4■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 GJB2P29033 226 aa23.4■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 TNKSO95271 1327 aa23.4■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 UNCXA6NJT0 531 aa23.39■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 PTPRAP18433 802 aa23.39■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.39■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 MTMR4Q9NYA4 1195 aa23.39■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 ZDHHC9Q9Y397 364 aa23.39■■□□□ 1.34
RALGPS1-204ENST00000373436 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 EVCP57679 992 aa23.38■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 ICA1Q05084 483 aa23.38■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 SCRN1Q12765 414 aa23.38■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 SART3Q15020 963 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 ELP3Q9H9T3 547 aa23.38■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.38■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa23.38■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 TMEM87BQ96K49 555 aa23.38■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 MTA3Q9BTC8 594 aa23.38■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.38■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 STX8Q9UNK0 236 aa23.38■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.37■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 ERICH2A1L162 156 aa23.37■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 USP17L5A8MUK1 530 aa23.37■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 HUNKP57058 714 aa23.37■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 SEC23AQ15436 765 aa23.37■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.37■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.37■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 RCSD1Q6JBY9 416 aa23.37■■□□□ 1.33
RALGPS1-204ENST00000373436 SAPCD2Q86UD0 394 aa23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms