RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373159.1

TRAPPC3-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-201ENST00000373159 USP5P45974 858 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 USP14P54578 494 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 CCNA1P78396 465 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 MAP2K5Q13163 448 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 CCL14Q16627 93 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 MIGA1Q8NAN2 632 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 APBA2Q99767 749 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 C1orf115Q9H7X2 142 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 ATAD5Q96QE3 1844 aa15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 PLXNB2O15031 1838 aa15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 MAP3K12Q12852 859 aa15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 LBX2Q6XYB7 198 aa15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 MAGEB6Q8N7X4 407 aa15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 FEZ1Q99689 392 aa15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 COL6A3P12111 3177 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 SLC15A5A6NIM6 579 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 RAB3GAP1Q15042 981 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 ABCB5Q2M3G0 1257 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 TDHQ8IZJ6 230 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 ACER1Q8TDN7 264 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 ANTXR1Q9H6X2 564 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 CABP5Q9NP86 173 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 ALPK3Q96L96 1907 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 HOXC6P09630 235 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 VCAM1P19320 739 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 PTPREP23469 700 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 MFSD14CQ5VZR4 134 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 ITPRIPQ8IWB1 547 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 DLL1O00548 723 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 RLBP1P12271 317 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 SHMT1P34896 483 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 PLCD1P51178 756 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 LRRC26Q2I0M4 334 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 ERC1Q8IUD2 1116 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 DEFB123Q8N688 67 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 FLRT1Q9NZU1 646 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 BTBD7Q9P203 1132 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 IGHA2P01877 340 aa15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 GUCY1A2P33402 732 aa15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 ATP2B2Q01814 1243 aa15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 GABPAQ06546 454 aa15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 GRB14Q14449 540 aa15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 CEP85Q6P2H3 762 aa15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 MAST2Q6P0Q8 1798 aa15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC3-201ENST00000373159 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 MSCO60682 206 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 WDR78Q5VTH9 848 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 AACSQ86V21 672 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 LPAR1Q92633 364 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 HOXC10Q9NYD6 342 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 FOCADQ5VW36 1801 aa15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 COG2Q14746 738 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 SEPT2Q15019 361 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 Q7L0L9 218 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 NPLOC4Q8TAT6 608 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 MTMR10Q9NXD2 777 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 A0A1W2PRG0 241 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 STRNO43815 780 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 RHPN1Q8TCX5 695 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 MCM9Q9NXL9 1143 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 PDE6AP16499 860 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 CNGA1P29973 690 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 CYP2C19P33261 490 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 TRPV1Q8NER1 839 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 DNM1LO00429 736 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 OLFML2BQ68BL8 750 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 DPP9Q86TI2 863 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 MB21D1Q8N884 522 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 ARRDC4Q8NCT1 418 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 SHCBP1Q8NEM2 672 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC3-201ENST00000373159 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms