RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354833.7

SERF1A-202, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1A, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1A-202ENST00000354833 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
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SERF1A-202ENST00000354833 YEATS4O95619 227 aa28.13■■■□□ 2.09
SERF1A-202ENST00000354833 POLD1P28340 1107 aa28.13■■■□□ 2.09
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SERF1A-202ENST00000354833 SOGA3Q5TF21 947 aa28.13■■■□□ 2.09
SERF1A-202ENST00000354833 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
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SERF1A-202ENST00000354833 KLHL34Q8N239 644 aa28.12■■■□□ 2.09
SERF1A-202ENST00000354833 LINC00301Q8NCQ3 95 aa28.12■■■□□ 2.09
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SERF1A-202ENST00000354833 VPS33BQ9H267 617 aa28.12■■■□□ 2.09
SERF1A-202ENST00000354833 STX8Q9UNK0 236 aa28.12■■■□□ 2.09
SERF1A-202ENST00000354833 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
SERF1A-202ENST00000354833 CLIC4Q9Y696 253 aa28.12■■■□□ 2.09
SERF1A-202ENST00000354833 V9GY48 417 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
SERF1A-202ENST00000354833 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP28.12■■■□□ 2.09
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SERF1A-202ENST00000354833 SWAP70Q9UH65 585 aa28.11■■■□□ 2.09
SERF1A-202ENST00000354833 SERPINB13Q9UIV8 391 aa28.11■■■□□ 2.09
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SERF1A-202ENST00000354833 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
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SERF1A-202ENST00000354833 OXER1Q8TDS5 423 aa28.02■■■□□ 2.08
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SERF1A-202ENST00000354833 ZNRF3Q9ULT6 936 aa28.02■■■□□ 2.08
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