RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 MAP3K14Q99558 947 aa22.23■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.23■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.22■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 PSMD14O00487 310 aa22.22■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 HLA-DOAP06340 250 aa22.22■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 KIF5BP33176 963 aa22.22■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 CACNB3P54284 484 aa22.22■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.22■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 SWAP70Q9UH65 585 aa22.22■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 COL4A5P29400 1685 aa22.22■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 CFAP100Q494V2 611 aa22.21■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.21■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.21■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 TMEM47Q9BQJ4 181 aa22.21■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.21■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.21■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 PSME4Q14997 1843 aa22.21■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 NIM1KQ8IY84 436 aa22.21■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
UPP1-201ENST00000331803 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 MMP1P03956 469 aa22.2■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 TCP10Q12799 353 aa22.2■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 PKN1Q16512 942 aa22.2■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 KLHL34Q8N239 644 aa22.2■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 PGBD1Q96JS3 809 aa22.2■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.2■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.2■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 CEP95Q96GE4 821 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 GMLQ99445 158 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 EHD4Q9H223 541 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 SYCE3A1L190 88 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.19■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.18■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 XBP1P17861 261 aa22.18■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 NOVP48745 357 aa22.18■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 GRM4Q14833 912 aa22.18■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.18■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.18■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 SHMT1P34896 483 aa22.18■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 PTGER2P43116 358 aa22.18■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.18■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.18■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.18■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 MYH6P13533 1939 aa22.17■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 AKR1B1P15121 316 aa22.17■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 OGFOD1Q8N543 542 aa22.17■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.17■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 CLIC4Q9Y696 253 aa22.17■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 BTBD18B2RXH4 712 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 GNAQP50148 359 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 LIG1P18858 919 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 MRE11P49959 708 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 MTMR7Q9Y216 660 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 BCS1LQ9Y276 419 aa22.16■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.15■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.15■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 YEATS4O95619 227 aa22.15■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 SPDYE6P0CI01 402 aa22.15■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 CXCL9Q07325 125 aa22.15■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.15■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 BICD2Q8TD16 824 aa22.15■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 JDP2Q8WYK2 163 aa22.15■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.15■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.15■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 NFKBIEO00221 500 aa22.14■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 ENTPD3O75355 529 aa22.14■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 DLGAP5Q15398 846 aa22.14■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 ANO1Q5XXA6 986 aa22.14■■□□□ 1.14
UPP1-201ENST00000331803 SHISA4Q96DD7 197 aa22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms