RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 PANX2Q96RD6 677 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXD1-201ENST00000331462 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
HOXD1-201ENST00000331462 FHOD1Q9Y613 1164 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXD1-201ENST00000331462 SEMA3EO15041 775 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXD1-201ENST00000331462 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
HOXD1-201ENST00000331462 PTPN21Q16825 1174 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXD1-201ENST00000331462 SPATA1Q5VX52 437 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXD1-201ENST00000331462 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXD1-201ENST00000331462 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
HOXD1-201ENST00000331462 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
HOXD1-201ENST00000331462 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
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HOXD1-201ENST00000331462 CUL4BQ13620 913 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 PDILTQ8N807 584 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 SCN7AQ01118 1682 aa25.7■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 A0A087X0B3 334 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 NPHP1O15259 732 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 CALM1P0DP23 149 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 CALM2P0DP24 149 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 CALM3P0DP25 149 aa25.69■■□□□ 1.7
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HOXD1-201ENST00000331462 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 TNFRSF25Q93038 417 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 CDKAL1Q5VV42 579 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 KIFC2Q96AC6 838 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 GSDMAQ96QA5 445 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 VPS54Q9P1Q0 977 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 MINDY4BA8MYZ0 360 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 COL4A1P02462 1669 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 PBX1P40424 430 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 CATIPQ7Z7H3 387 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 PAGE5Q96GU1 130 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 CARD6Q9BX69 1037 aa25.68■■□□□ 1.7
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HOXD1-201ENST00000331462 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 MRFAP1Q9Y605 127 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 FAM205CA6NFA0 338 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 DDAH1O94760 285 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 CASQ1P31415 396 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 ADKP55263 362 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 DPYDQ12882 1025 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 DHX58Q96C10 678 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 WDR24Q96S15 920 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 GNG11P61952 73 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 TROAPQ12815 778 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 ATP8B1O43520 1251 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 ATP2B1P20020 1258 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 UBE4AQ14139 1066 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 NPY5RQ15761 445 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
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HOXD1-201ENST00000331462 EPSTI1Q96J88 318 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 CTAGE1Q96RT6 745 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 BRMS1Q9HCU9 246 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.65■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 MYH2Q9UKX2 1941 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 TMCO3Q6UWJ1 677 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 IQCA1Q86XH1 822 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 CD44P16070 742 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 FECHP22830 423 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
HOXD1-201ENST00000331462 IGSF3O75054 1194 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC175P0C221 793 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 ABCF2Q9UG63 623 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 ITIH6Q6UXX5 1313 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 TRAPPC10P48553 1259 aa25.63■■□□□ 1.69
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HOXD1-201ENST00000331462 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP25.63■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 V9GY48 417 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 TTC38Q5R3I4 469 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 SMIM22K7EJ46 135 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 WNT7AO00755 349 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 TEX33O43247 280 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 ORC4O43929 436 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 ATP6V1AP38606 617 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 PPP2R3AQ06190 1150 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC51Q96ER9 411 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 LAMB1P07942 1786 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 PRDM1O75626 825 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD1-201ENST00000331462 AFMP43652 599 aa25.61■■□□□ 1.69
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