RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322175.7

TPRX1-201, Transcript of tetrapeptide repeat homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TPRX1, Length 1,924 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRX1-201ENST00000322175 ZHX2Q9Y6X8 837 aa18.27■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 E7EWF7 191 aa18.26■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 GH2P01242 217 aa18.26■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 PTPRAP18433 802 aa18.26■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 ECE1P42892 770 aa18.26■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 WNK4Q96J92 1243 aa18.26■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 MKNK2Q9HBH9 465 aa18.26■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 SWAP70Q9UH65 585 aa18.26■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 CTNNA3Q9UI47 895 aa18.26■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 NUCB2P80303 420 aa18.25■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 ERO1BQ86YB8 467 aa18.25■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 SPDYE5A6NIY4 337 aa18.25■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 IRF6O14896 467 aa18.25■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 ABCB5Q2M3G0 1257 aa18.25■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 NBPF3Q9H094 633 aa18.25■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 ZNF213O14771 459 aa18.24■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 AKR1B1P15121 316 aa18.24■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 CLEC17AQ6ZS10 378 aa18.24■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa18.24■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 PPATQ06203 517 aa18.23■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 NOGQ13253 232 aa18.23■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 ANKRD1Q15327 319 aa18.23■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 ANAPC4Q9UJX5 808 aa18.23■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 ROBO3Q96MS0 1386 aa18.23■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 ZMYM6O95789 1325 aa18.23■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 ASNSP08243 561 aa18.23■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 RASA1P20936 1047 aa18.23■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 GUCY1A2P33402 732 aa18.23■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 PDE4BQ07343 736 aa18.23■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 Q6ZUG5 572 aa18.23■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 CCDC83Q8IWF9 413 aa18.23■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 NECAB1Q8N987 351 aa18.23■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 SEPT2Q15019 361 aa18.22■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 FAM47AQ5JRC9 791 aa18.22■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 TBC1D10CQ8IV04 446 aa18.22■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 NKX2-3Q8TAU0 364 aa18.22■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 CABP5Q9NP86 173 aa18.22■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa18.22■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 TRIM75PA6NK02 468 aa18.21■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 USP17L5A8MUK1 530 aa18.21■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 SPP2Q13103 211 aa18.21■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 CLEC10AQ8IUN9 316 aa18.21■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 LRRC2Q9BYS8 371 aa18.21■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 AGXT2Q9BYV1 514 aa18.21■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 TOMM22Q9NS69 142 aa18.21■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 DTNBO60941 627 aa18.21■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 BRD1O95696 1058 aa18.21■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 PPIL2Q13356 520 aa18.21■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 DGKZQ13574 1117 aa18.21■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 MS4A4AQ96JQ5 239 aa18.21■□□□□ 0.51
TPRX1-201ENST00000322175 LAMA4Q16363 1823 aa18.2■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 LAMB1P07942 1786 aa18.2■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 MAP2K2P36507 400 aa18.2■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 CCDC17Q96LX7 622 aa18.2■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP18.2■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 ZNF287Q9HBT7 754 aa18.2■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP18.2■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 DOCK1Q14185 1865 aa18.2■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 ATAD5Q96QE3 1844 aa18.19■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 TFAP4Q01664 338 aa18.19■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 AKNAD1Q5T1N1 836 aa18.19■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 MFSD6Q6ZSS7 791 aa18.19■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 ZNF280CQ8ND82 737 aa18.19■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 BAG4O95429 457 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 TMEM179Q6ZVK1 233 aa18.19■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 ACER1Q8TDN7 264 aa18.19■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 TAOK2Q9UL54 1235 aa18.19■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 FGRP09769 529 aa18.18■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 CHST3Q7LGC8 479 aa18.18■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 SIAH1Q8IUQ4 282 aa18.18■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 FBXL16Q8N461 479 aa18.18■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 STAG1Q8WVM7 1258 aa18.18■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 BRF1Q92994 677 aa18.18■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 PTPN18Q99952 460 aa18.18■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 NEDD4P46934 1319 aa18.18■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa18.17■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 TSPY3P0CV98 308 aa18.17■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 TSPY8P0CW00 308 aa18.17■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 GTF2A2P52657 109 aa18.17■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 SNAPC2Q13487 334 aa18.17■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 CCL15Q16663 113 aa18.17■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 BRI3BPQ8WY22 251 aa18.17■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 GBP4Q96PP9 640 aa18.17■□□□□ 0.5
TPRX1-201ENST00000322175 GINM1Q9NU53 330 aa18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms