RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299687.9

ZNF407-201, Transcript of zinc finger protein 407, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF407, Length 7,948 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407-201ENST00000299687 GNPTABQ3T906 1256 aa13.51□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 HDAC11Q96DB2 347 aa13.51□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 TTC4O95801 387 aa13.51□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 KIF9Q9HAQ2 790 aa13.51□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 CYP26C1Q6V0L0 522 aa13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 NLRX1Q86UT6 975 aa13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 GLG1Q92896 1179 aa13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 TNNI1P19237 187 aa13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 PDE4DQ08499 809 aa13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 ANKRD35Q8N283 1001 aa13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 NOP14P78316 857 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 DCLK2Q8N568 766 aa13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 EPS15L1Q9UBC2 864 aa13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 SLC8A2Q9UPR5 921 aa13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 ELP1O95163 1332 aa13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 MRC2Q9UBG0 1479 aa13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 SERPINB6P35237 376 aa13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 TNFAIP1Q13829 316 aa13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 TRIML1Q8N9V2 468 aa13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 CCDC87Q9NVE4 849 aa13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 LZTS2Q9BRK4 669 aa13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 NUCB1Q02818 461 aa13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 ATL3Q6DD88 541 aa13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 NCAPH2Q6IBW4 605 aa13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 TMX3Q96JJ7 454 aa13.5□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 PYGLP06737 847 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 LMBR1LQ6UX01 489 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 BBS5Q8N3I7 341 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 RPS6KC1Q96S38 1066 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 TMOD1P28289 359 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 SLC1A4P43007 532 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 TUBB2AQ13885 445 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 TUBB2BQ9BVA1 445 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 RNF217Q8TC41 542 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 VPS37BQ9H9H4 285 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 IFT140Q96RY7 1462 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 RNF40O75150 1001 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 FLOT1O75955 427 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 FBXW4P57775 412 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 STK25O00506 426 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 GNGT2O14610 69 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 SAT1P21673 171 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 KRT33BQ14525 404 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 PTPREP23469 700 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 C1orf228Q6PIY5 440 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 MAP3K7CLP57077 242 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 ARHGEF16Q5VV41 709 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 VPS16Q9H269 839 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 TEKT2Q9UIF3 430 aa13.49□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 CALCRLQ16602 461 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 CHST3Q7LGC8 479 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 MAP3K7O43318 606 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 ALDH1L1O75891 902 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 PPP2R5AQ15172 486 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 DEPTORQ8TB45 409 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 RAB17Q9H0T7 212 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 STAM2O75886 525 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 TNNC2P02585 160 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 CPXCR1Q8N123 301 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 GCNAQ96QF7 691 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 RABEP2Q9H5N1 569 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 ZRANB1Q9UGI0 708 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 ALDH1B1P30837 517 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 VPS41P49754 854 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 MLXIPQ9HAP2 919 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 KSR2Q6VAB6 950 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 ST7Q9NRC1 585 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 THEGQ9P2T0 379 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 JAG2Q9Y219 1238 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 PLEKHG3A1L390 1219 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 STX2P32856 288 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 USH1GQ495M9 461 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 AKAP4Q5JQC9 854 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 NLRP7Q8WX94 980 aa13.48□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 TRIM27P14373 513 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 ECE1P42892 770 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 MTMR3Q13615 1198 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 BEND3Q5T5X7 828 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 IGSF22Q8N9C0 903 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 MYO1AQ9UBC5 1043 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 DRC3Q9H069 523 aa13.47□□□□□ -0.25
ZNF407-201ENST00000299687 OGFRQ9NZT2 677 aa13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms