RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 CSRNP2Q9H175 543 aa22.05■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.05■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.04■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 SBF2Q86WG5 1849 aa22.04■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 PRR29P0C7W0 189 aa22.04■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 SBK1Q52WX2 424 aa22.04■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 PDILTQ8N807 584 aa22.04■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 BMP6P22004 513 aa22.04■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.04■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.04■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.04■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 PDE4BQ07343 736 aa22.03■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.03■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 USP49Q70CQ1 688 aa22.03■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.03■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.03■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 LY75O60449 1722 aa22.03■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 TSPY2A6NKD2 308 aa22.02■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 USP17L8P0C7I0 530 aa22.02■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 GRAPQ13588 217 aa22.02■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.02■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 SERPINC1P01008 464 aa22.01■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 UBASH3AP57075 661 aa22.01■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.01■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 DPF2Q92785 391 aa22.01■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 SMARCE1Q969G3 411 aa22.01■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 NFIXQ14938 502 aa22.01■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 FANCLQ9NW38 375 aa22.01■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 WNT7AO00755 349 aa22■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 CBFA2T2O43439 604 aa22■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 USP5P45974 858 aa22■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 NPY5RQ15761 445 aa22■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 CEP135Q66GS9 1140 aa22■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 TNFRSF25Q93038 417 aa22■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.99■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.99■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 CNBD1Q8NA66 436 aa21.99■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.99■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 ZNF592Q92610 1267 aa21.99■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.99■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 SARSP49591 514 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 PTPN14Q15678 1187 aa21.99■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 ZNF174Q15697 407 aa21.99■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 CFAP100Q494V2 611 aa21.99■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 KANK3Q6NY19 840 aa21.99■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa21.99■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 ZBTB22O15209 634 aa21.98■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 MORC3Q14149 939 aa21.98■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 ZNF827Q17R98 1081 aa21.98■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 RCSD1Q6JBY9 416 aa21.98■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 NYAP1Q6ZVC0 841 aa21.98■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 DHX58Q96C10 678 aa21.98■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 EPSTI1Q96J88 318 aa21.98■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 MYO1BO43795 1136 aa21.98■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 BMP15O95972 392 aa21.98■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 SCG2P13521 617 aa21.98■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 TTC38Q5R3I4 469 aa21.98■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 KCND1Q9NSA2 647 aa21.98■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 XDHP47989 1333 aa21.97■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 A0A087X0B3 334 aa21.97■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 CTIFO43310 598 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 NLRP5P59047 1200 aa21.97■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 TFAP4Q01664 338 aa21.97■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 DIXDC1Q155Q3 683 aa21.97■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 GRIK5Q16478 980 aa21.97■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 C12orf60Q5U649 245 aa21.97■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 DYNLL2Q96FJ2 89 aa21.97■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 MLKLQ8NB16 471 aa21.97■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 FERMT2Q96AC1 680 aa21.97■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 KAT14Q9H8E8 782 aa21.97■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 DACH1Q9UI36 760 aa21.97■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa21.96■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.96■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.96■■□□□ 1.11
USP21-201ENST00000289865 TMEM232C9JQI7 657 aa21.95■■□□□ 1.1
USP21-201ENST00000289865 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
USP21-201ENST00000289865 KIF5BP33176 963 aa21.95■■□□□ 1.1
USP21-201ENST00000289865 CCDC112Q8NEF3 446 aa21.95■■□□□ 1.1
USP21-201ENST00000289865 NAV1Q8NEY1 1877 aa21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 787.5 ms