RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 MCM7P33993 719 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 LONP1P36776 959 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 UBXN1Q04323 297 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 ZNF569Q5MCW4 686 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 HDXQ7Z353 690 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 KRT86O43790 486 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 BCAMP50895 628 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 STX17P56962 302 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 SPECC1Q5M775 1068 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 TPTE2Q6XPS3 522 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 BRIP1Q9BX63 1249 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 IGSF3O75054 1194 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 RASGRF1Q13972 1273 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 KARSQ15046 597 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 CCDC102AQ96A19 550 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 MYO1AQ9UBC5 1043 aa9.99□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 SPEF2Q9C093 1822 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 MYL1P05976 194 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 LONRF3Q496Y0 759 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 CSRNP2Q9H175 543 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 MCM9Q9NXL9 1143 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 VPS54Q9P1Q0 977 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 CDR1P51861 262 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 CHMP4BP1P59074 171 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 SEMA3FQ13275 785 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 HLFQ16534 295 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 LCORLQ8N3X6 602 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 WDR66Q8TBY9 1149 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 CRACR2AQ9BSW2 395 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 UBN2Q6ZU65 1347 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 LAD1O00515 517 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 KRT18P05783 430 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 CDC27P30260 824 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 TANGO6Q9C0B7 1094 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 TMX1Q9H3N1 280 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 MYO6Q9UM54 1294 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 LDHBP07195 334 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 SCARF1Q14162 830 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 SHC4Q6S5L8 630 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 RABGGTAQ92696 567 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 LZTFL1Q9NQ48 299 aa9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 ERICH4A6NGS2 130 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 H7C1D1 291 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 SCG2P13521 617 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 NELFBQ8WX92 580 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 NAPAP54920 295 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 ARID5BQ14865 1188 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 LRP10Q7Z4F1 713 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 CUEDC2Q9H467 287 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 ACSBG1Q96GR2 724 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 SH3GLB2Q9NR46 395 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 IVLP07476 585 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 PAFAH1B1P43034 410 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 CRKLP46109 303 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 HSPA2P54652 639 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 ARMCX5Q6P1M9 558 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 AIFM3Q96NN9 605 aa9.97□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 CNNM4Q6P4Q7 775 aa9.96□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa9.96□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 BLIDQ8IZY5 108 aa9.96□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.96□□□□□ -0.81
HERC3-201ENST00000264345 GSG1L2A8MUP6 293 aa9.96□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 TACC1O75410 805 aa9.96□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 CHGBP05060 677 aa9.96□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 ADKP55263 362 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 MORC3Q14149 939 aa9.96□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 ZNF34Q8IZ26 560 aa9.96□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 RWDD2AQ9UIY3 292 aa9.96□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 A0A087WWV3 80 aa9.96□□□□□ -0.82
HERC3-201ENST00000264345 ASIC1P78348 528 aa9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.1 ms