RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261407.8

LPCAT3-201, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LPCAT3, Length 2,268 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3-201ENST00000261407 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
LPCAT3-201ENST00000261407 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
LPCAT3-201ENST00000261407 GNPATO15228 680 aa22.02■■□□□ 1.12
LPCAT3-201ENST00000261407 DHX58Q96C10 678 aa22.02■■□□□ 1.12
LPCAT3-201ENST00000261407 KRT2P35908 639 aa22.01■■□□□ 1.11
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF174Q15697 407 aa22.01■■□□□ 1.11
LPCAT3-201ENST00000261407 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
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LPCAT3-201ENST00000261407 AFMP43652 599 aa22.01■■□□□ 1.11
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LPCAT3-201ENST00000261407 SMARCE1Q969G3 411 aa22■■□□□ 1.11
LPCAT3-201ENST00000261407 KCND1Q9NSA2 647 aa22■■□□□ 1.11
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LPCAT3-201ENST00000261407 SYT10Q6XYQ8 523 aa21.98■■□□□ 1.11
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LPCAT3-201ENST00000261407 TSPY2A6NKD2 308 aa21.95■■□□□ 1.1
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LPCAT3-201ENST00000261407 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.95■■□□□ 1.1
LPCAT3-201ENST00000261407 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.95■■□□□ 1.1
LPCAT3-201ENST00000261407 MLKLQ8NB16 471 aa21.95■■□□□ 1.1
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LPCAT3-201ENST00000261407 PAGE5Q96GU1 130 aa21.95■■□□□ 1.1
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LPCAT3-201ENST00000261407 CALM3P0DP25 149 aa21.94■■□□□ 1.1
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LPCAT3-201ENST00000261407 MTMR7Q9Y216 660 aa21.93■■□□□ 1.1
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LPCAT3-201ENST00000261407 PCP11498 1178 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
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LPCAT3-201ENST00000261407 MCM7P33993 719 aa21.92■■□□□ 1.1
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