RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tomm22Q9CPQ3 142 aa33.36■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cacna1fQ9JIS7 1985 aa33.35■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Palm3A2TJV2 734 aa33.35■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 A430078G23RikE9Q7Y4 484 aa33.35■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccdc66Q6NS45 935 aa33.35■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Scfd1Q8BRF7 639 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rasgrp4Q8BTM9 673 aa33.35■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kiaa1524Q8BWY9 907 aa33.35■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmod2Q9JKK7 351 aa33.35■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Triml1Q8BVP1 470 aa33.34■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Shtn1Q8K2Q9 631 aa33.34■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ubac1Q8VDI7 409 aa33.34■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 GrapQ9CX99 217 aa33.34■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Akap2O54931 893 aa33.34■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Usp31E9Q6Y8 1344 aa33.33■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sema3fO88632 785 aa33.33■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nol12Q8BG17 217 aa33.33■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Txnrd2Q9JLT4 524 aa33.33■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP33.33■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Wdr93Q402B2 695 aa33.32■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Adgrg6Q6F3F9 1165 aa33.32■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 SdsQ8VBT2 327 aa33.32■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sept2P42208 361 aaKnown RBP33.31■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Bace1P56818 501 aa33.31■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 CgnP59242 1191 aa33.31■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lrrc2Q8VDB8 371 aa33.31■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccar2Q8VDP4 922 aaKnown RBP33.31■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gpaa1Q9WTK3 621 aa33.31■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dnai2A2AC93 623 aa33.3■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Galnt17Q7TT15 598 aa33.3■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Spon1Q8VCC9 807 aa33.3■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lonrf3Q9D4H7 753 aa33.3■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Acot3Q9QYR7 432 aa33.3■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Plcb2A3KGF7 1181 aa33.3■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Stag2O35638 1231 aa33.3■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zfp317Q8C0Q5 607 aa33.3■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Srgap1Q91Z69 1062 aa33.3■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zcchc17Q9ESX4 241 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 XdhQ00519 1335 aa33.29■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 A0A1Y7VML8 143 aa33.29■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 FosbP13346 338 aa33.29■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm11437Q5QR91 290 aa33.29■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zbtb39Q6PDK0 712 aa33.29■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nap1l3Q794H2 544 aa33.29■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Scfd2Q8BTY8 684 aa33.29■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trex1Q91XB0 314 aa33.29■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Riox2Q8CD15 465 aa33.28■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 C8aQ8K182 587 aa33.28■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Stxbp2Q64324 593 aa33.27■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ssh1Q76I79 1042 aa33.27■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 DpydQ8CHR6 1025 aa33.27■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Aldh1b1Q9CZS1 519 aa33.27■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fgl2P12804 432 aa33.26■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rnf180Q3U827 592 aa33.26■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Armc2Q3URY6 854 aa33.26■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tshz1Q5DTH5 1084 aa33.26■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nsrp1Q5NCR9 542 aa33.26■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc27a1Q60714 646 aa33.26■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP33.26■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AllcQ9JHX6 414 aa33.26■■■□□ 2.92
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pfkfb3A7UAK5 555 aa33.26■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cyp3a25O09158 503 aa33.26■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Myo19Q5SV80 963 aa33.26■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Haus6Q6NV99 933 aaKnown RBP33.26■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mapk4Q6P5G0 583 aa33.26■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Inpp5bQ8K337 993 aa33.26■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tob2Q9JM55 345 aa33.26■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dnm1P39053 867 aa33.25■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Swap70Q6A028 585 aaKnown RBP33.25■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Phf20Q8BLG0 1010 aaKnown RBP33.25■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tfap4Q9JIZ5 338 aa33.25■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 B3galt4Q9Z0F0 371 aa33.25■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 TicrrQ8BQ33 1889 aa33.24■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Grm4Q68EF4 912 aa33.24■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Phf20l1Q8CCJ9 1013 aa33.24■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Eid1Q9DCR4 169 aa33.24■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccng2O08918 344 aa33.22■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cplx1P63040 134 aa33.22■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ifit1Q64282 463 aa33.22■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccdc148Q6P5U8 527 aa33.22■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Myh14Q6URW6 2000 aa33.22■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ppef2O35385 757 aa33.21■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 L1camP11627 1260 aa33.21■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Acnat2Q8BGG9 420 aa33.21■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Igbp1bQ9QZ29 343 aa33.21■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm5114W4VSN8 858 aa33.21■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm30191A0A0U1RNT7 187 aa33.21■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nfil3O08750 462 aa33.21■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 U2af2P26369 475 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ubash3aQ3V3E1 624 aa33.21■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 RadxQ8C779 850 aa33.21■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 SltmQ8CH25 1031 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Plcd1Q8R3B1 756 aa33.21■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gmcl1Q920G9 524 aa33.21■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Inpp4aQ9EPW0 939 aa33.21■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Scn10aQ6QIY3 1958 aa33.21■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zfp953Q3UPV7 304 aa33.2■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 MycbpapQ5SUV2 932 aa33.2■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Spata21Q8BHW6 681 aa33.2■■■□□ 2.91
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ddx20Q9JJY4 825 aaKnown RBP33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 100.9 ms