RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001872.4

Hoxd13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd13, Length 2,483 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm9736A0A1W2P7N1 277 aa9,89□□□□□ -0,83
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Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm5965D3Z724 196 aa9,84□□□□□ -0,83
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kiaa1109A2AAE1 5005 aa9,81□□□□□ -0,84
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Birc6O88738 4882 aa9,8□□□□□ -0,84
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm17416Q30KP4 66 aa9,79□□□□□ -0,84
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm19426M0QWC7 77 aa9,78□□□□□ -0,84
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krtap19-5O08632 62 aa9,76□□□□□ -0,85
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ndufaf8A2AMZ4 74 aa9,76□□□□□ -0,85
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Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Herc1E9PZP8 4859 aa9,34□□□□□ -0,91
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2310057N15RikQ9D6T8 200 aa9,33□□□□□ -0,92
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Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sec61bQ9CQS8 96 aaKnown RBP8,81□□□□□ -1
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm10318A0A1W2P728 225 aa8,79□□□□□ -1
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Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Crct1Q6PAI5 102 aa8,68□□□□□ -1,02
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krtap16-3Q8C1I6 86 aa8,68□□□□□ -1,02
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Prm1P02319 51 aa8,59□□□□□ -1,03
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm9789Q8BIG3 52 aa8,59□□□□□ -1,03
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm7735D3YX18 52 aa8,58□□□□□ -1,04
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 4932415D10RikA0A1W2P6U8 4986 aa8,54□□□□□ -1,04
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Hoxd13-201ENSMUST00000001872 ZanO88799 5376 aa8,4□□□□□ -1,06
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tnp1P10856 55 aa8,34□□□□□ -1,07
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krtap1-3A2A588 173 aa8,32□□□□□ -1,08
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Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lce1jD3YUU5 139 aa8,16□□□□□ -1,1
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Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rnf213E9Q555 5152 aaKnown RBP8,06□□□□□ -1,12
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Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krtap12-1Q9Z287 130 aa7,98□□□□□ -1,13
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2310046K23RikA0A0A6YVW6 87 aa7,94□□□□□ -1,14
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Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krtap17-1A2A5X6 109 aa7,74□□□□□ -1,17
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 SspoQ8CG65 4998 aa7,74□□□□□ -1,17
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Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm10061D3Z714 54 aa7,68□□□□□ -1,18
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krtap9-3Q3V2C1 136 aa7,68□□□□□ -1,18
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Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lce1a2Q9D1K4 149 aa7,62□□□□□ -1,19
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lce1hQ9D6R3 140 aa7,56□□□□□ -1,2
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Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krtap19-2Q925I0 141 aa7,39□□□□□ -1,23
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lce1dQ9D731 133 aa7,37□□□□□ -1,23
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krtap9-5A2A5X3 358 aa7,34□□□□□ -1,24
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krtap4-1Q3UUY3 169 aa7,21□□□□□ -1,26
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Muc5bE9Q5I3 4800 aa7,17□□□□□ -1,26
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Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lce1eQ9D139 143 aa7,09□□□□□ -1,27
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Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm11938Q9D3H4 131 aa7,02□□□□□ -1,29
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mt2P02798 61 aa6,99□□□□□ -1,29
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lce1gQ9D195 139 aa6,98□□□□□ -1,29
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm6358A0A087WPH4 74 aa6,96□□□□□ -1,3
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sprr2dO70555 85 aa6,9□□□□□ -1,31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Syne2Q6ZWQ0 6874 aaKnown RBP6,89□□□□□ -1,31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm11555B1AQ89 175 aa6,85□□□□□ -1,31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krtap4-6Q3V4B7 195 aa6,84□□□□□ -1,31
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm11562A0PK51 136 aa6,84□□□□□ -1,32
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm11596B1AQB0 205 aa6,76□□□□□ -1,33
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 A0A1Y7VJH8 109 aa6,73□□□□□ -1,33
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm10272F7CZ33 110 aa6,73□□□□□ -1,33
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Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krtap4-7Q9D732 168 aa6,71□□□□□ -1,34
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lce1cQ9D1C5 147 aa6,68□□□□□ -1,34
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm11564A2A4L9 201 aa6,51□□□□□ -1,37
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm11595B1AQA7 289 aa6,51□□□□□ -1,37
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krtap4-8B1AQA8 209 aa6,51□□□□□ -1,37
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krtap22-2J3QNX6 67 aa6,5□□□□□ -1,37
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fsip2A2ARZ3 6995 aa6,5□□□□□ -1,37
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Krtap28-10A0A1Y7VP58 119 aa6,46□□□□□ -1,38
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm10100J3QK64 120 aa6,46□□□□□ -1,38
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