RNA–Protein interactions for RNA: tC(GCA)B

tC(GCA)B, Transcript of Cysteine tRNA (tRNA-Cys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tC(GCA)B, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tC(GCA)BtC(GCA)B REC107P21651 314 aa3.26□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B ASF1P32447 279 aa3.26□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B KRE6P32486 720 aa3.26□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B ADD66P36040 267 aa3.26□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B YHR020WP38708 688 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B SPT8P38915 602 aa3.26□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B VAC8P39968 578 aa3.26□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B YEL075CP39972 122 aa3.26□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B SPO22P40511 975 aa3.26□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B EMW1P42842 904 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B SWC4P53201 476 aa3.26□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B RTS3P53289 263 aa3.26□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B YTP1P53584 459 aa3.26□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B YMR160WQ03823 816 aa3.26□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B PPM1Q04081 328 aa3.26□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B EMI1Q04406 187 aa3.26□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B YPR109WQ06104 294 aa3.26□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B OMS1Q06668 471 aa3.26□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B PLB3Q08108 686 aa3.26□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B YOR342CQ12182 319 aa3.26□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B NSI1Q12457 570 aa3.26□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B BPH1P25356 2167 aa3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B FOB1O13329 566 aa3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B JIP3O13555 125 aa3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B TUP1P16649 713 aa3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B GAL11P19659 1081 aa3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B AEP2P22136 580 aa3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B KAR9P32526 644 aa3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B DOM34P33309 386 aa3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B EBP2P36049 427 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B RSM22P36056 628 aa3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B HSL7P38274 827 aa3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B EXO5P38289 585 aa3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B CBR1P38626 284 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B SRP68P38687 599 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B YHL017WP38745 532 aa3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B LRP1P38801 184 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B RPS26AP39938 119 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B RPS26BP39939 119 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B EDC3P39998 551 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B PMT4P46971 762 aa3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B BNA3P47039 444 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B RPC17P47076 161 aa3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B PCL10P53124 433 aa3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B SPC105P53148 917 aa3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B RTC4P53850 401 aa3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B TEP1P53916 434 aa3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B NUP53Q03790 475 aa3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B EMP46Q12396 444 aa3.25□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B YCR102CP25608 368 aa3.24□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B ADY2P25613 283 aa3.24□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B MRP4P32902 394 aa3.24□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B SRP72P38688 640 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B DSS1P39112 969 aa3.24□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B YEL057CP39983 233 aa3.24□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B TOK1P40310 691 aa3.24□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B YIL086CP40503 102 aa3.24□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B TRF5P48561 642 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B DRN1P53255 507 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B SDH1Q00711 640 aa3.24□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B REG1Q00816 1014 aa3.24□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B INP2Q03824 705 aa3.24□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B GAD1Q04792 585 aa3.24□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B BDS1Q08347 646 aa3.24□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B TCO89Q08921 799 aa3.24□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B HIS1P00498 297 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B CPA2P03965 1118 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B RBK1P25332 333 aa3.23□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B DAL2P25335 343 aa3.23□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B RFA2P26754 273 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B GSY2P27472 705 aa3.23□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B VRP1P37370 817 aa3.23□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B CCT6P39079 546 aa3.23□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B MBP1P39678 833 aa3.23□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B PAC1P39946 494 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B ZRG8P40021 1076 aa3.23□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B GTS1P40956 396 aa3.23□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B CSN12P47130 423 aa3.23□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B BPL1P48445 690 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B DMA2P53924 522 aa3.23□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B UBP3Q01477 912 aaKnown RBP RIP-Chip data3.23□□□□□ -1.89not detected
tC(GCA)BtC(GCA)B COG8Q04632 607 aa3.23□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B YDL073WQ07454 984 aa3.23□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B RLP24Q07915 199 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B THI20Q08224 551 aa3.23□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B RSA1Q08932 381 aa3.23□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B YDL211CQ12121 372 aa3.23□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B BAG7Q12128 409 aa3.23□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B MCD1Q12158 566 aa3.23□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B PHO2P07269 559 aa3.22□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B MTF2P10849 440 aa3.22□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B SPS100P13130 326 aa3.22□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B URA1P28272 314 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B GDA1P32621 518 aa3.22□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B SCD5P34758 872 aa3.22□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B CAB3P36076 571 aa3.22□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B SPC42P36094 363 aa3.22□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B FMP46P36141 133 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B MRPL15P36523 253 aa3.22□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B YMC2P38087 329 aa3.22□□□□□ -1.89
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