RNA–Protein interactions for RNA: YOR299W

BUD7, Transcript of Member of the ChAPs family (Chs5p-Arf1p-binding proteins), yeast

Gene BUD7, Length 2,241 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD7	YOR299W	YGR111W	P53265	400 aa		5	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	ADA2	Q02336	434 aa		5	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	TAF10	Q12030	206 aa		5	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	SFL1	P20134	766 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	GAC1	P28006	793 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	FRE1	P32791	686 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	YKL107W	P34251	309 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	PCH2	P38126	564 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	CAJ1	P39101	391 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	ZAP1	P47043	880 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	NPY1	P53164	384 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	BTN2	P53286	410 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	TRE1	Q08919	783 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	JIP3	O13555	125 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	MSS18	P08593	268 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	SYN8	P31377	255 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	MRP4	P32902	394 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	DOM34	P33309	386 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	YKL050C	P35736	922 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	AGP2	P38090	596 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	MUM2	P38236	366 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	CKB2	P38930	258 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	STB4	P50104	949 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	YDR222W	Q04925	415 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.99	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	HOM3	P10869	527 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	ERS1	P17261	260 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	DAL3	P32459	195 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	SAF1	P38352	637 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	JJJ1	P53863	590 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	VAC14	Q06708	880 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
BUD7	YOR299W	GPM2	Q12008	311 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	APM4	Q99186	491 aa		4.98	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	BI2	P03873	423 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	BI4	P03879	638 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	PUT4	P15380	627 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	TKL2	P33315	681 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	RCK2	P38623	610 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	TMA108	P40462	946 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	VPS25	P47142	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	KAP114	P53067	1004 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	MUB1	Q03162	620 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	ARO80	Q04052	950 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	SOV1	Q04748	898 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	SML1	Q04964	104 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	SIL1	Q08199	421 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	NHA1	Q99271	985 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	PET111	P08468	800 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	YEL043W	P32618	956 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	FMP10	P40098	244 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	SEC9	P40357	651 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	SNZ3	P43545	298 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	SNZ2	P53824	298 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	BOP3	P53958	396 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	NGL3	Q03210	505 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	THI72	Q08579	599 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BUD7	YOR299W	PRC1	P00729	532 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	ERG11	P10614	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	STE11	P23561	717 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	PGS1	P25578	521 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	ERR3	P42222	437 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	SLS1	P42900	643 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	PNG1	Q02890	363 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YIG1	Q08956	461 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	DBF4	P32325	704 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	SPC29	P33419	253 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	HIS2	P38635	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	NEM1	P38757	446 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YJL045W	P47052	634 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	MAL13	P53338	473 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	TDA6	Q06466	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	MDM38	Q08179	573 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BUD7	YOR299W	AIM39	Q08223	395 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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