RNA–Protein interactions for RNA: YJR001W

AVT1, Transcript of Vacuolar transporter, yeast

Gene AVT1, Length 1,809 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AVT1	YJR001W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	MSG5	P38590	489 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	SHU2	P38957	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	YJR061W	P40355	935 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	YIL165C	P40446	119 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	SIP4	P46954	829 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	TOM22	P49334	152 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	TOF2	Q02208	771 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	PEX29	Q03370	554 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	YAP6	Q03935	383 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	KRE28	Q04431	385 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	MGR3	Q04472	501 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	BUG1	Q12191	341 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	AHC1	Q12433	566 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	LDB19	Q12502	818 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	KRE5	P22023	1365 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	CLB4	P24871	460 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	DMC1	P25453	334 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	REC104	P33323	182 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	YKL063C	P35725	167 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	PXL1	P36166	706 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	ALG3	P38179	458 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	POP7	P38291	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	TCD1	P38756	429 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	RRM3	P38766	723 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	MRX1	P40050	688 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	ATF1	P40353	525 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	RRN7	P40992	514 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	THI6	P41835	540 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	BNA6	P43619	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	MDV1	P47025	714 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	ABM1	P47146	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	ECL1	P48235	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	NCS6	P53088	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	MPS2	P53159	387 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	BSC5	P53755	489 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	SPC2	Q04969	178 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	GRX6	Q12438	231 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.56	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	EDE1	P34216	1381 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	YLR358C	O13565	187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	STE3	P06783	470 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	KIP1	P28742	1111 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	SEC65	P29478	273 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	TGL1	P34163	548 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	CTF13	P35203	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	VPS51	P36116	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	SAK1	P38990	1142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	UME6	P39001	836 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	PIK1	P39104	1066 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	AGE2	P40529	298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	YFL066C	P43538	392 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	HNT2	P49775	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	HFM1	P51979	1187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	DSD1	P53095	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	ORM1	P53224	222 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	PML39	Q03760	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	IVY1	Q04934	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	MCH5	Q08777	521 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	ENV7	Q12003	364 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	TUS1	Q06412	1307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	MKS1	P34072	584 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	ADD66	P36040	267 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	STB6	P36085	766 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	VRP1	P37370	817 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	YBR138C	P38277	524 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	SMF2	P38778	549 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	EFM4	P40516	257 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	IRC5	P43610	853 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AVT1	YJR001W	HXT16	P47185	567 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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