RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	MLEC	Q14165	292 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	MAP7	Q14244	749 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	ATG4C	Q96DT6	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	IGSF3	O75054	1194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	LRIG2	O94898	1065 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	ETFB	P38117	255 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	RBL2	Q08999	1139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	FAM13C	Q8NE31	585 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	UBXN4	Q92575	508 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	GATA6	Q92908	595 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	TP53INP1	Q96A56	240 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	TM9SF2	Q99805	663 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	FOXQ1	Q9C009	403 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	KLHL3	Q9UH77	587 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	RAX	Q9Y2V3	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	ACR	P10323	421 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	CASP7	P55210	303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	ARSH	Q5FYA8	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	PAOX	Q6QHF9	649 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	BEND4	Q6ZU67	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	RGS13	O14921	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	KLF4	O43474	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	GUCY2C	P25092	1073 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	RXRB	P28702	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	TNNI3K	Q59H18	835 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	CRBN	Q96SW2	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	SLC9A7	Q96T83	725 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	HMX2	A2RU54	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	SLITRK5	O94991	958 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	CCNF	P41002	786 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	CDK5R2	Q13319	367 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	NFKBIB	Q15653	356 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	ZAR1	Q86SH2	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	USP35	Q9P2H5	1018 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175		A0A1W2PQH9	124 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	UBOX5	O94941	541 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	RAG1	P15918	1043 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	ADM	P35318	185 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	SERINC3	Q13530	473 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	DOC2B	Q14184	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	RNF43	Q68DV7	783 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	TTC6	Q86TZ1	520 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	KIF2C	Q99661	725 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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