RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		19.93	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	APPBP2	Q92624	585 aa		19.93	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	FSD1	Q9BTV5	496 aa		19.93	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	WDR18	Q9BV38	432 aa		19.93	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	19.93	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		19.93	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	CPA4	Q9UI42	421 aa		19.93	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		19.93	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYH1	P12882	1939 aa		19.92	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	GH2	P01242	217 aa		19.92	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHGB	P05060	677 aa		19.92	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	HMGCS2	P54868	508 aa		19.92	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		19.92	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		19.92	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	19.92	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	LNPK	Q9C0E8	428 aa		19.92	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	PNMA3	Q9UL41	463 aa		19.92	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		19.92	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		19.92	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	C19orf81	C9J6K1	198 aa		19.91	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP17L10	C9JJH3	530 aa		19.91	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	CYP2C8	P10632	490 aa		19.91	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		19.91	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	C17orf99	Q6UX52	265 aa		19.91	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		19.91	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	19.9	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	OSBP	P22059	807 aa		19.9	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	BACE1	P56817	501 aa		19.9	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	MTMR2	Q13614	643 aa		19.9	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMC5	Q8IY18	1101 aa		19.9	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	SWAP70	Q9UH65	585 aa		19.9	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		19.9	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP17L12	C9JPN9	530 aa		19.89	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP17L21	D6R901	530 aa		19.89	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGHD	P01880	384 aa		19.89	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	APP	P05067	770 aa		19.89	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	GNAT2	P19087	354 aa		19.89	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	PDE1A	P54750	535 aa		19.89	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	19.89	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	JAG1	P78504	1218 aa		19.89	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	19.89	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		19.89	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	19.89	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	FEZ1	Q99689	392 aa		19.89	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	STAP2	Q9UGK3	403 aa		19.89	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	19.88	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	CYP2D6	P10635	497 aa		19.88	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	SHMT1	P34896	483 aa		19.88	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	GABPA	Q06546	454 aa		19.88	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	TREML2	Q5T2D2	321 aa		19.88	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	C12orf60	Q5U649	245 aa		19.88	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		19.88	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	OSBP2	Q969R2	916 aa		19.88	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	EVI5L	Q96CN4	794 aa		19.88	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		19.88	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	SIPA1L1	O43166	1804 aa		19.88	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		19.87	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYH7	P12883	1935 aa		19.87	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPAA1	O43292	621 aa		19.87	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	19.87	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	GNRH1	P01148	92 aa		19.87	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	HOXD10	P28358	340 aa		19.87	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	19.87	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		19.87	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	19.87	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		19.87	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		19.86	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	PSMC4	P43686	418 aa		19.86	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	19.86	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		19.86	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	CTR9	Q6PD62	1173 aa		19.86	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		19.86	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		19.86	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		19.86	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		19.85	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		19.85	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	19.85	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	TDO2	P48775	406 aa		19.85	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP14	P54578	494 aa		19.85	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	FCGRT	P55899	365 aa		19.85	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	NUCB1	Q02818	461 aa		19.85	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC17	Q96LX7	622 aa		19.85	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		19.84	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		19.84	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		19.84	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	19.84	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035		M0R2C6	588 aa		19.84	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	BCR	P11274	1271 aa		19.84	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDK8	P49336	464 aa		19.84	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRMT2	P55345	433 aa		19.84	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	EVX2	Q03828	476 aa		19.84	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	19.84	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		19.84	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		19.84	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		19.84	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	19.84	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	SEPT2	Q15019	361 aa		19.83	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	SBK1	Q52WX2	424 aa		19.83	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		19.83	■□□□□ 0.77
JMJD1C-211	ENST00000633035	NBPF11	Q86T75	865 aa		19.83	■□□□□ 0.77

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