RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626583.2

LINC01828-208, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1828, human

TSL 5

Gene LINC01828, Length 848 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01828-208	ENST00000626583	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	BTBD11	A6QL63	1104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	PSMC4	P43686	418 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	AAK1	Q2M2I8	961 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	GJD3	Q8N144	294 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	TIFA	Q96CG3	184 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	SETDB2	Q96T68	719 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC01828-208	ENST00000626583	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	ABCC12	Q96J65	1359 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	C6orf229	H3BNL8	230 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	GNRH1	P01148	92 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	COL6A1	P12109	1028 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	CLCN1	P35523	988 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	LYPD8	Q6UX82	237 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	ADSSL1	Q8N142	457 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	NUP98	P52948	1817 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	FRYL	O94915	3013 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	FAM177B	A6PVY3	158 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583		H0Y858	1186 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	DCX	O43602	365 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	ADCY3	O60266	1144 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	TLR2	O60603	784 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	BCR	P11274	1271 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	ALAD	P13716	330 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	GAS6	Q14393	721 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	KIF22	Q14807	665 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	KRT40	Q6A162	431 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	BAD	Q92934	168 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	TLR9	Q9NR96	1032 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	MBIP	Q9NS73	344 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	SPG7	Q9UQ90	795 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	CABP4	P57796	275 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	CRY2	Q49AN0	593 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	C17orf99	Q6UX52	265 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	SP8	Q8IXZ3	490 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	PRR7	Q8TB68	274 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	FOXJ1	Q92949	421 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	PBX4	Q9BYU1	374 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	CDC14C	A4D256	554 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	4.8	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	ARID5B	Q14865	1188 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	VPS33B	Q9H267	617 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	RTL1	A6NKG5	1358 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC01828-208	ENST00000626583	RFXAP	O00287	272 aa		4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.5 ms