RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 ZNF280CQ8ND82 737 aa26.94■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 GDF15Q99988 308 aa26.94■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP26.94■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP26.94■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 PLXNB2O15031 1838 aa26.94■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 FAM196BA6NMK8 535 aa26.93■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 GPR153Q6NV75 609 aa26.93■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 C7orf61Q8IZ16 206 aa26.93■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa26.93■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 RPTORQ8N122 1335 aa26.92■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 SPP2Q13103 211 aa26.92■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 FLT1P17948 1338 aa26.91■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 NBPF3Q9H094 633 aa26.91■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 MYH1P12882 1939 aa26.9■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 HMGCS2P54868 508 aa26.9■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa26.9■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 PI4KBQ9UBF8 816 aa26.9■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 CAP2P40123 477 aa26.89■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 AS3MTQ9HBK9 375 aa26.89■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 GJD2Q9UKL4 321 aa26.89■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.89■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 SH3D19Q5HYK7 790 aa26.88■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 AACSQ86V21 672 aa26.88■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa26.88■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.88■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 COL6A3P12111 3177 aa26.87■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 USP17L5A8MUK1 530 aa26.87■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 CERS3Q8IU89 383 aa26.87■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 RHPN1Q8TCX5 695 aa26.87■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 C11orf49Q9H6J7 331 aa26.87■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 DNAJC18Q9H819 358 aa26.87■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 MORF4L1Q9UBU8 362 aa26.87■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa26.86■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 TRIB2Q92519 343 aa26.86■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 OGDHLQ9ULD0 1010 aa26.86■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 IDH1O75874 414 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 CYP7A1P22680 504 aa26.85■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 TRIM32Q13049 653 aa26.85■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 LRIT3Q3SXY7 679 aa26.85■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.85■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 SOCS4Q8WXH5 440 aa26.85■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 COG6Q9Y2V7 657 aa26.85■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 HMMRO75330 724 aa26.84■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 TDHQ8IZJ6 230 aa26.84■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 ANTXR1Q9H6X2 564 aa26.84■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa26.84■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.84■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa26.84■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 NAV1Q8NEY1 1877 aa26.83■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa26.83■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 DEFB123Q8N688 67 aa26.83■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 KIF1BPQ96EK5 621 aa26.83■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 FRMPD3Q5JV73 1810 aa26.83■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 ASNSP08243 561 aa26.82■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 SYN1P17600 705 aa26.82■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 MTMR2Q13614 643 aa26.82■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 MAGEB6Q8N7X4 407 aa26.82■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 WDR18Q9BV38 432 aa26.82■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 GINM1Q9NU53 330 aa26.82■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 PALD1Q9ULE6 856 aa26.82■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 MAP3K12Q12852 859 aa26.81■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 NUDT12Q9BQG2 462 aa26.81■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 TMOD4Q9NZQ9 345 aa26.81■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 CYP2B6P20813 491 aa26.8■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 BACE1P56817 501 aa26.8■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 MIGA1Q8NAN2 632 aa26.8■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 PFASO15067 1338 aa26.8■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 HLA-DOAP06340 250 aa26.79■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 PDE3AQ14432 1141 aa26.79■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa26.79■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 HERVK_113P62684 666 aa26.78■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 JAG1P78504 1218 aa26.78■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa26.78■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms