RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 ZNF280CQ8ND82 737 aa26.94■■□□□ 1.9
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SRRT-218ENST00000620394 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
SRRT-218ENST00000620394 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP26.94■■□□□ 1.9
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SRRT-218ENST00000620394 C7orf61Q8IZ16 206 aa26.93■■□□□ 1.9
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SRRT-218ENST00000620394 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.88■■□□□ 1.89
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SRRT-218ENST00000620394 USP17L5A8MUK1 530 aa26.87■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 CERS3Q8IU89 383 aa26.87■■□□□ 1.89
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SRRT-218ENST00000620394 C11orf49Q9H6J7 331 aa26.87■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 DNAJC18Q9H819 358 aa26.87■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 MORF4L1Q9UBU8 362 aa26.87■■□□□ 1.89
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SRRT-218ENST00000620394 TRIB2Q92519 343 aa26.86■■□□□ 1.89
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SRRT-218ENST00000620394 CYP7A1P22680 504 aa26.85■■□□□ 1.89
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SRRT-218ENST00000620394 TRIM32Q13049 653 aa26.85■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 LRIT3Q3SXY7 679 aa26.85■■□□□ 1.89
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SRRT-218ENST00000620394 SOCS4Q8WXH5 440 aa26.85■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 COG6Q9Y2V7 657 aa26.85■■□□□ 1.89
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SRRT-218ENST00000620394 DEFB123Q8N688 67 aa26.83■■□□□ 1.89
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SRRT-218ENST00000620394 FRMPD3Q5JV73 1810 aa26.83■■□□□ 1.89
SRRT-218ENST00000620394 ASNSP08243 561 aa26.82■■□□□ 1.88
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SRRT-218ENST00000620394 SYN1P17600 705 aa26.82■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 MTMR2Q13614 643 aa26.82■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 MAGEB6Q8N7X4 407 aa26.82■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 WDR18Q9BV38 432 aa26.82■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 GINM1Q9NU53 330 aa26.82■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 PALD1Q9ULE6 856 aa26.82■■□□□ 1.88
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SRRT-218ENST00000620394 NUDT12Q9BQG2 462 aa26.81■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
SRRT-218ENST00000620394 TMOD4Q9NZQ9 345 aa26.81■■□□□ 1.88
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SRRT-218ENST00000620394 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
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SRRT-218ENST00000620394 HERVK_113P62684 666 aa26.78■■□□□ 1.88
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SRRT-218ENST00000620394 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
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