RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 SNX1Q13596 522 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 TEX11Q8IYF3 940 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 KAZALD1Q96I82 304 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 RGPD1P0DJD0 1748 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 ENO4A6NNW6 628 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 POTEB2H3BUK9 544 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 AGPSO00116 658 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 CHUKO15111 745 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 STX10O60499 249 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 PFKFB2O60825 505 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 RXRAP19793 462 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 TFCP2Q12800 502 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 KIF9Q9HAQ2 790 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 DENND2AQ9ULE3 1009 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 ASAP1Q9ULH1 1129 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 A0A087WZG4 1122 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 IGKV5-2P06315 115 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 CABP4P57796 275 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 ADALQ6DHV7 355 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 JMYQ8N9B5 988 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 GBP3Q9H0R5 595 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 KLC4Q9NSK0 619 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM94Q12767 1356 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 GRIN2DO15399 1336 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 SPTLC2O15270 562 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 C21orf2O43822 256 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 MYBL1P10243 752 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC24Q50LG9 513 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 PTF1AQ7RTS3 328 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 TTC5Q8N0Z6 440 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00301Q8NCQ3 95 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 PARD3BQ8TEW8 1205 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 KCNB2Q92953 911 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 ZBTB10Q96DT7 871 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 DBNDD2Q9BQY9 259 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 TAF5LO75529 589 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 ARHGEF25Q86VW2 580 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 CEP120Q8N960 986 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 IRAK4Q9NWZ3 460 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 BACH1O14867 736 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 MYO1BO43795 1136 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 UPP2O95045 317 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 STX17P56962 302 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 TRDNQ13061 729 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 IFT88Q13099 833 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 KRT32Q14532 448 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 KLHL10Q6JEL2 608 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 LMBR1LQ6UX01 489 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 OLFM4Q6UX06 510 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC148Q8NFR7 591 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 ARL8AQ96BM9 186 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 GUCA1BQ9UMX6 200 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 GOLGA6BA6NDN3 693 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 NEURL1BA8MQ27 555 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 OPLAHO14841 1288 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 CDC25AP30304 524 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 SEC24CP53992 1094 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 RBL2Q08999 1139 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 GCKRQ14397 625 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 TBC1D31Q96DN5 1066 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 MMS19Q96T76 1030 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 BPIFA3Q9BQP9 254 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 HMG20BQ9P0W2 317 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 MTMR7Q9Y216 660 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-211ENST00000618610 IKBKBO14920 756 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms