RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SHC4Q6S5L8 630 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BPIFA3Q9BQP9 254 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MAST2Q6P0Q8 1798 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ST5P78524 1137 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SBF2Q86WG5 1849 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TROAPQ12815 778 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CERKQ8TCT0 537 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NLRP12P59046 1061 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KCNF1Q9H3M0 494 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPTLC3Q9NUV7 552 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 JAG2Q9Y219 1238 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BAG3O95817 575 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LDHCP07864 332 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FUT2Q10981 343 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GYS1P13807 737 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PTGS1P23219 599 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CRY2Q49AN0 593 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIAA1524Q8TCG1 905 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ATP2B4P23634 1241 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP5P45974 858 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CERS3Q8IU89 383 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CLIC6Q96NY7 704 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KCNH3Q9ULD8 1083 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A087WWV3 80 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TSPY2A6NKD2 308 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SERPINB2P05120 415 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TPM4P67936 248 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NR5A1Q13285 461 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PKN1Q16512 942 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM13BQ9NYF5 915 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CYP2D6P10635 497 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PTPREP23469 700 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KRT2P35908 639 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PPP4CP60510 307 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FBXW7Q969H0 707 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PHF20Q9BVI0 1012 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TUBE1Q9UJT0 475 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SMTNL1A8MU46 457 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BBOX1O75936 387 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GPSM2P81274 684 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM47AQ5JRC9 791 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C12orf60Q5U649 245 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HSPA1LP34931 641 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC178Q5BJE1 867 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OXER1Q8TDS5 423 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CABP5Q9NP86 173 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GGA1Q9UJY5 639 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KRBA2Q6ZNG9 492 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CNNM3Q8NE01 707 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PYCARDQ9ULZ3 195 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LAMB1P07942 1786 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BIN1O00499 593 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UFL1O94874 794 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USP17L8P0C7I0 530 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIF5BP33176 963 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BMP15O95972 392 aa21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms