RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602223.5

STRN4-223, Transcript of striatin 4, human

TSL 4

Gene STRN4, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STRN4-223	ENST00000602223	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		15	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	GNRH1	P01148	92 aa		14.99	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	CTGF	P29279	349 aa		14.99	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	PLCD1	P51178	756 aa		14.99	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	TREML2	Q5T2D2	321 aa		14.99	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		14.99	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	GPATCH3	Q96I76	525 aa		14.99	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	ARMT1	Q9H993	441 aa		14.99	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	BRCA2	P51587	3418 aa		14.99	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	CHGB	P05060	677 aa		14.98	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	HMGCS2	P54868	508 aa		14.98	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	BACE1	P56817	501 aa		14.98	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		14.98	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	ARMC5	Q96C12	935 aa		14.98	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		14.98	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	PNMA3	Q9UL41	463 aa		14.98	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		14.98	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		14.97	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	MBD4	O95243	580 aa		14.97	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	PSMC4	P43686	418 aa		14.97	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	PRMT2	P55345	433 aa		14.97	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	GABPA	Q06546	454 aa		14.97	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	MTMR2	Q13614	643 aa		14.97	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		14.97	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	TRIM47	Q96LD4	638 aa		14.97	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		14.96	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	C19orf81	C9J6K1	198 aa		14.96	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	USP17L10	C9JJH3	530 aa		14.96	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	PRKAB2	O43741	272 aa		14.96	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	GH2	P01242	217 aa		14.96	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	SHMT1	P34896	483 aa		14.96	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	EVX2	Q03828	476 aa		14.96	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	14.96	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	14.96	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		14.96	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		14.96	□□□□□ -0.01
STRN4-223	ENST00000602223	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	OSBP	P22059	807 aa		14.95	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	HOXD10	P28358	340 aa		14.95	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	AAMP	Q13685	434 aa		14.95	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		14.95	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	ZNF333	Q96JL9	665 aa		14.95	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		14.95	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	SRRD	Q9UH36	339 aa		14.95	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		14.95	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		14.94	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	CYP2D6	P10635	497 aa		14.94	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	FCGRT	P55899	365 aa		14.94	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		14.94	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		14.94	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		14.94	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	GCC1	Q96CN9	775 aa		14.94	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	PLXNB2	O15031	1838 aa		14.94	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	MYPN	Q86TC9	1320 aa		14.93	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	ERC2	O15083	957 aa		14.93	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	GUCY1A2	P33402	732 aa		14.93	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		14.93	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	NBPF11	Q86T75	865 aa		14.93	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		14.93	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	APPBP2	Q92624	585 aa		14.93	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	C12orf42	Q96LP6	360 aa		14.93	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	CABP5	Q9NP86	173 aa		14.93	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		14.93	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	SWAP70	Q9UH65	585 aa		14.93	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		14.93	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	POTEF	A5A3E0	1075 aa		14.92	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	MX1	P20591	662 aa		14.92	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		14.92	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		14.92	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	C12orf60	Q5U649	245 aa		14.92	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		14.92	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	OSBP2	Q969R2	916 aa		14.92	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	RLF	Q13129	1914 aa		14.92	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	PARP14	Q460N5	1801 aa		14.92	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	USP17L12	C9JPN9	530 aa		14.91	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	USP17L21	D6R901	530 aa		14.91	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	PRKCZ	Q05513	592 aa		14.91	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	SEPT2	Q15019	361 aa		14.91	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		14.91	□□□□□ -0.02
STRN4-223	ENST00000602223	RAET1E	Q8TD07	263 aa		14.91	□□□□□ -0.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms