RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.72■□□□□ 0.91
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HERC3-214ENST00000601319 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
HERC3-214ENST00000601319 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.72■□□□□ 0.91
HERC3-214ENST00000601319 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.72■□□□□ 0.91
HERC3-214ENST00000601319 CHGBP05060 677 aa20.71■□□□□ 0.91
HERC3-214ENST00000601319 JAG1P78504 1218 aa20.71■□□□□ 0.91
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HERC3-214ENST00000601319 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.71■□□□□ 0.91
HERC3-214ENST00000601319 C17orf99Q6UX52 265 aa20.71■□□□□ 0.91
HERC3-214ENST00000601319 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.71■□□□□ 0.91
HERC3-214ENST00000601319 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.71■□□□□ 0.91
HERC3-214ENST00000601319 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.71■□□□□ 0.91
HERC3-214ENST00000601319 STAP2Q9UGK3 403 aa20.71■□□□□ 0.91
HERC3-214ENST00000601319 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.91
HERC3-214ENST00000601319 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
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HERC3-214ENST00000601319 ARHGEF6Q15052 776 aa20.7■□□□□ 0.9
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HERC3-214ENST00000601319 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.69■□□□□ 0.9
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HERC3-214ENST00000601319 BACE1P56817 501 aa20.68■□□□□ 0.9
HERC3-214ENST00000601319 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
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HERC3-214ENST00000601319 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.67■□□□□ 0.9
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HERC3-214ENST00000601319 BCRP11274 1271 aa20.67■□□□□ 0.9
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HERC3-214ENST00000601319 C12orf60Q5U649 245 aa20.65■□□□□ 0.9
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HERC3-214ENST00000601319 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
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HERC3-214ENST00000601319 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.64■□□□□ 0.89
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HERC3-214ENST00000601319 USP17L21D6R901 530 aa20.63■□□□□ 0.89
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HERC3-214ENST00000601319 C12orf42Q96LP6 360 aa20.63■□□□□ 0.89
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HERC3-214ENST00000601319 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.62■□□□□ 0.89
HERC3-214ENST00000601319 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.62■□□□□ 0.89
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HERC3-214ENST00000601319 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.62■□□□□ 0.89
HERC3-214ENST00000601319 OSBPP22059 807 aa20.61■□□□□ 0.89
HERC3-214ENST00000601319 GUCY1A2P33402 732 aa20.61■□□□□ 0.89
HERC3-214ENST00000601319 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
HERC3-214ENST00000601319 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.61■□□□□ 0.89
HERC3-214ENST00000601319 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.61■□□□□ 0.89
HERC3-214ENST00000601319 SLC44A5Q8NCS7 719 aa20.61■□□□□ 0.89
HERC3-214ENST00000601319 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
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