RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598934.5

LINC00854-210, Long intergenic non-protein coding RNA 854, human

TSL 5

Gene LINC00854, Length 337 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00854-210	ENST00000598934	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	FAM35A	Q86V20	835 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	SMC5	Q8IY18	1101 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	SLC9A7	Q96T83	725 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	KIF2C	Q99661	725 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	C2CD2L	O14523	706 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	TNFRSF10C	O14798	259 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	TSPAN6	O43657	245 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	PPFIA3	O75145	1194 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	SDS	P20132	328 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	CCNF	P41002	786 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	GUCY2F	P51841	1108 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	EPHB1	P54762	984 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	CTBS	Q01459	385 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	GSTM4	Q03013	218 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	GAS6	Q14393	721 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	LRRC41	Q15345	812 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	FAM182B	Q5T319	152 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	CDC6	Q99741	560 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	KLHL3	Q9UH77	587 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	WIZ	O95785	1651 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		4.53	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934		A0A1W2PQU0	124 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	FAM177B	A6PVY3	158 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	AGRP	O00253	132 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	KIF3B	O15066	747 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	KATNA1	O75449	491 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	FGFR3	P22607	806 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	CDC27	P30260	824 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	GNAL	P38405	381 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	CABP4	P57796	275 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	BIRC2	Q13490	618 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	PPP2R5A	Q15172	486 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	SV2C	Q496J9	727 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	HDX	Q7Z353	690 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	SYT9	Q86SS6	491 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	RELT	Q969Z4	430 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	SHTN1	A0MZ66	631 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	CDC14C	A4D256	554 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	RASGRP1	O95267	797 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	ECEL1	O95672	775 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	EYA4	O95677	639 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	EPHA1	P21709	976 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	CDC25B	P30305	580 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	PDE4B	Q07343	736 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	MCL1	Q07820	350 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	RIN3	Q8TB24	985 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LINC00854-210	ENST00000598934	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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