RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594708.1

SMC5-AS1-201, Transcript of SMC5 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC5-AS1, Length 1,818 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC5-AS1-201ENST00000594708 APLP1P51693 650 aa23.18■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TAOK2Q9UL54 1235 aa23.18■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 AKR1B1P15121 316 aa23.17■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 VGLL4Q14135 290 aa23.17■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SAPCD2Q86UD0 394 aa23.17■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.17■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.17■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 E7EWF7 191 aa23.17■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HUNKP57058 714 aa23.17■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.17■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RNF20Q5VTR2 975 aa23.17■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ORC4O43929 436 aa23.16■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GH2P01242 217 aa23.16■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DOCK1Q14185 1865 aa23.16■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.16■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.15■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.15■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KCNB2Q92953 911 aa23.15■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CSADQ9Y600 493 aa23.15■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.15■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 B4E1Z4 1266 aa23.15■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PCP11498 1178 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 C1QTNF8P60827 252 aa23.15■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ELP3Q9H9T3 547 aa23.15■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.15■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.15■■□□□ 1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TFAP4Q01664 338 aa23.14■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.14■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.14■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CCDC17Q96LX7 622 aa23.14■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MCCP23508 829 aa23.13■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GUCY1A2P33402 732 aa23.13■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HTRA3P83110 453 aa23.13■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.13■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CREBZFQ9NS37 354 aa23.13■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TSPY2A6NKD2 308 aa23.12■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KDM4AO75164 1064 aa23.12■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TSPY3P0CV98 308 aa23.12■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TSPY8P0CW00 308 aa23.12■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.12■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.12■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.12■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CABP5Q9NP86 173 aa23.12■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ASNSP08243 561 aa23.12■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TRDNQ13061 729 aa23.12■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SEPT2Q15019 361 aa23.12■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.12■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ESR2Q92731 530 aa23.12■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.12■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRT23Q9C075 422 aa23.12■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PICK1Q9NRD5 415 aa23.12■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZSWIM5Q9P217 1185 aa23.12■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PTPRAP18433 802 aa23.11■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.11■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NCOA7Q8NI08 942 aa23.11■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 UNCXA6NJT0 531 aa23.1■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NMT2O60551 498 aa23.1■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NEDD1Q8NHV4 660 aa23.1■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.1■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CYB5R4Q7L1T6 521 aa23.1■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.1■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RGMBQ6NW40 437 aa23.09■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CHST3Q7LGC8 479 aa23.09■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 OPTNQ96CV9 577 aa23.09■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 OTUD5Q96G74 571 aa23.09■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NEK1Q96PY6 1258 aa23.09■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IL17RBQ9NRM6 502 aa23.09■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.09■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.08■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRT32Q14532 448 aa23.08■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ERO1BQ86YB8 467 aa23.08■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CEP95Q96GE4 821 aa23.08■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.08■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GINM1Q9NU53 330 aa23.08■■□□□ 1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa23.08■■□□□ 1.28
SMC5-AS1-201ENST00000594708 USP17L5A8MUK1 530 aa23.08■■□□□ 1.28
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GJA5P36382 358 aa23.08■■□□□ 1.28
SMC5-AS1-201ENST00000594708 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
SMC5-AS1-201ENST00000594708 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PLIN4Q96Q06 1357 aa23.08■■□□□ 1.28
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.07■■□□□ 1.28
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CPA1P15085 419 aa23.06■■□□□ 1.28
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ANTXR2P58335 489 aa23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms