RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591914.5

SMAD4-213, Transcript of SMAD family member 4, human

TSL 3

Gene SMAD4, Length 992 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD4-213	ENST00000591914	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SMAD4-213	ENST00000591914	TRIM17	Q9Y577	477 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SMAD4-213	ENST00000591914	PRKAB2	O43741	272 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SMAD4-213	ENST00000591914	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
SMAD4-213	ENST00000591914	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
SMAD4-213	ENST00000591914	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
SMAD4-213	ENST00000591914	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SMAD4-213	ENST00000591914	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SMAD4-213	ENST00000591914	HTT	P42858	3142 aa		32.82	■■■□□ 2.85
SMAD4-213	ENST00000591914	GABPA	Q06546	454 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	EFCC1	Q9HA90	598 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	CYP2C8	P10632	490 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	SHMT1	P34896	483 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	SMC5	Q8IY18	1101 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	CPA4	Q9UI42	421 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	HMGCS2	P54868	508 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	EVX2	Q03828	476 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	APPBP2	Q92624	585 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	STAP2	Q9UGK3	403 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	GH2	P01242	217 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	TREML2	Q5T2D2	321 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	IGHD	P01880	384 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	CYP2D6	P10635	497 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	BACE1	P56817	501 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	ARHGEF6	Q15052	776 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	OSBP2	Q969R2	916 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SMAD4-213	ENST00000591914	MTMR2	Q13614	643 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	BCR	P11274	1271 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	C19orf81	C9J6K1	198 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	PDE1A	P54750	535 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	KIF22	Q14807	665 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	USP17L10	C9JJH3	530 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	C12orf60	Q5U649	245 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	SWAP70	Q9UH65	585 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	PNMA3	Q9UL41	463 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	USP17L12	C9JPN9	530 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	USP17L21	D6R901	530 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	FSD1	Q9BTV5	496 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	LNPK	Q9C0E8	428 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	32.71	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	CABP5	Q9NP86	173 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	GNRH1	P01148	92 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	CTGF	P29279	349 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	CTR9	Q6PD62	1173 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		32.7	■■■□□ 2.83
SMAD4-213	ENST00000591914		M0R2C6	588 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	GPAA1	O43292	621 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	GUCY1A2	P33402	732 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	SMIM22	K7EJ46	135 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	NUCB1	Q02818	461 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	TRIM47	Q96LD4	638 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	CENPF	P49454	3210 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	MYH8	P13535	1937 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	GNAT2	P19087	354 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	PSMC4	P43686	418 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	EVI5L	Q96CN4	794 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	OSBP	P22059	807 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	RGS19	P49795	217 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	SEPT2	Q15019	361 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	SBK1	Q52WX2	424 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	C12orf42	Q96LP6	360 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	CDK8	P49336	464 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SMAD4-213	ENST00000591914	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		32.65	■■■□□ 2.82

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