RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 GJA3Q9Y6H8 435 aa30.51■■■□□ 2.48
SCAMP4-210ENST00000588555 NID2Q14112 1375 aa30.51■■■□□ 2.48
SCAMP4-210ENST00000588555 JAK2O60674 1132 aa30.51■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 HLA-DOAP06340 250 aa30.51■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 IL17RBQ9NRM6 502 aa30.51■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 ZDHHC9Q9Y397 364 aa30.51■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC12A7Q9Y666 1083 aa30.51■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 CLRN2A0PK11 232 aa30.5■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 ZBTB43O43298 467 aa30.5■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 WNT10BO00744 389 aa30.49■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 CHMP4CQ96CF2 233 aa30.49■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa30.49■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 TMOD2Q9NZR1 351 aa30.49■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP30.49■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 FKBP1CQ5VVH2 108 aa30.49■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 RCSD1Q6JBY9 416 aa30.49■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 MICU3Q86XE3 530 aa30.49■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 MYL10Q9BUA6 226 aa30.49■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 SWAP70Q9UH65 585 aa30.49■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 MYH8P13535 1937 aa30.48■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 TSPY3P0CV98 308 aa30.48■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 TSPY8P0CW00 308 aa30.48■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 RXRAP19793 462 aa30.48■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 RCAN1P53805 252 aa30.48■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 NBPF9Q3BBW0 867 aa30.48■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 MICALL2Q8IY33 904 aa30.48■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 EGFRP00533 1210 aa30.47■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 SHMT1P34896 483 aa30.47■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF654Q8IZM8 581 aa30.47■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 DNAJC18Q9H819 358 aa30.47■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 PI4KBQ9UBF8 816 aa30.47■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 CNTNAP1P78357 1384 aa30.47■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 BRD1O95696 1058 aa30.46■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 SYT1P21579 422 aa30.46■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 NEDD1Q8NHV4 660 aa30.46■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 PLIN4Q96Q06 1357 aa30.46■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 PTPDC1A2A3K4 754 aa30.46■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 TCP10L2B9ZVM9 353 aa30.46■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 CDC27P30260 824 aa30.46■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 GPC2Q8N158 579 aa30.46■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKS1AQ92625 1134 aa30.46■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 TAOK2Q9UL54 1235 aa30.46■■■□□ 2.47
SCAMP4-210ENST00000588555 GOLGA8AA7E2F4 631 aa30.45■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa30.45■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 DGKHQ86XP1 1220 aa30.45■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 MYO1BO43795 1136 aa30.44■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 SLURP2P0DP57 97 aa30.44■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 ADD1P35611 737 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM151AQ8WW52 585 aa30.44■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC178Q5BJE1 867 aa30.43■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa30.43■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP30.43■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 RNF181Q9P0P0 153 aa30.43■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 TROAPQ12815 778 aa30.43■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 VEZTQ9HBM0 779 aa30.43■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 STX6O43752 255 aa30.42■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 NTRK3Q16288 839 aa30.42■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 SAMD7Q7Z3H4 446 aa30.42■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM83AQ86UY5 434 aa30.42■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 DDX11Q96FC9 970 aa30.42■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 NOVP48745 357 aa30.41■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 CPLX1O14810 134 aa30.41■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 FDPSP14324 419 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 AKR1B1P15121 316 aa30.41■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 CATIPQ7Z7H3 387 aa30.41■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 FANCBQ8NB91 859 aa30.41■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 DDAH1O94760 285 aa30.4■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 PDCP20941 246 aa30.4■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 CSRNP1Q96S65 589 aa30.4■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 GPRC5DQ9NZD1 345 aa30.4■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa30.39■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM196BA6NMK8 535 aa30.39■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 PPFIA3O75145 1194 aa30.39■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 RTN1Q16799 776 aa30.39■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 TATDN1Q6P1N9 297 aa30.39■■■□□ 2.46
SCAMP4-210ENST00000588555 NFKBIBQ15653 356 aa30.38■■■□□ 2.45
SCAMP4-210ENST00000588555 C9orf131Q5VYM1 1079 aa30.38■■■□□ 2.45
SCAMP4-210ENST00000588555 NUP133Q8WUM0 1156 aa30.38■■■□□ 2.45
SCAMP4-210ENST00000588555 CEP95Q96GE4 821 aa30.38■■■□□ 2.45
SCAMP4-210ENST00000588555 PGAP2Q9UHJ9 254 aa30.38■■■□□ 2.45
SCAMP4-210ENST00000588555 MTMR6Q9Y217 621 aa30.38■■■□□ 2.45
SCAMP4-210ENST00000588555 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
SCAMP4-210ENST00000588555 PPP2R5BQ15173 497 aa30.38■■■□□ 2.45
SCAMP4-210ENST00000588555 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa30.38■■■□□ 2.45
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