RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580515.5

TSPOAP1-AS1-206, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 980 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TATDN1Q6P1N9 297 aa29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SERPINB13Q9UIV8 391 aa29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa29.21■■■□□ 2.27
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SH3TC2Q8TF17 1288 aa29.18■■■□□ 2.26
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PLCD1P51178 756 aa29.17■■■□□ 2.26
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa29.16■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RAET1EQ8TD07 263 aa29.16■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GH2P01242 217 aa29.15■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ECHDC1Q9NTX5 307 aa29.15■■■□□ 2.26
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PRKCZQ05513 592 aa29.14■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SDR42E1Q8WUS8 393 aa29.14■■■□□ 2.26
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 EN2P19622 333 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GRK4P32298 578 aa29.13■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SHMT1P34896 483 aa29.13■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GABPAQ06546 454 aa29.13■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 UBE3CQ15386 1083 aa29.13■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ARMT1Q9H993 441 aa29.13■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa29.13■■■□□ 2.25
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GABRQQ9UN88 632 aa29.12■■■□□ 2.25
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NAV1Q8NEY1 1877 aa29.11■■■□□ 2.25
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SLAIN1Q8ND83 568 aa29.08■■■□□ 2.25
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MTFR1Q15390 333 aa29.07■■■□□ 2.24
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PXYLP1Q8TE99 480 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa29.06■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SWAP70Q9UH65 585 aa29.05■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa29.04■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 UBXN2AP68543 259 aa29.04■■■□□ 2.24
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FEZ1Q99689 392 aa29.04■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
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TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SEPT2Q15019 361 aa29.02■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 C12orf60Q5U649 245 aa29.02■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SLC44A5Q8NCS7 719 aa29.02■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CRBNQ96SW2 442 aa29.02■■■□□ 2.24
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TXNRD2Q9NNW7 524 aa29.02■■■□□ 2.24
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