RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IFNAR1P17181 557 aa27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MCM9Q9NXL9 1143 aa27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LAMB1P07942 1786 aa27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FGRP09769 529 aa27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PCP11498 1178 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GSTO1P78417 241 aa27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MYSM1Q5VVJ2 828 aa27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KINO60870 393 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RXRBP28702 533 aa27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USP5P45974 858 aa27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ME1P48163 572 aa27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IQCA1Q86XH1 822 aa27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FSIP1Q8NA03 581 aa27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IL1R1P14778 569 aa27.79■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FANCBQ8NB91 859 aa27.79■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PKNOX2Q96KN3 472 aa27.79■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RTEL1Q9NZ71 1219 aa27.79■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP27.79■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CLIC4Q9Y696 253 aa27.79■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STK36Q9NRP7 1315 aa27.79■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A087WWV3 80 aa27.79■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USP17L8P0C7I0 530 aa27.79■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRIM29Q14134 588 aa27.79■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRRC8AQ8IWT6 810 aa27.79■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GUCY1A2P33402 732 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SBK1Q52WX2 424 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM47AQ5JRC9 791 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MSL1Q68DK7 614 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRIM22Q8IYM9 498 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANO10Q9NW15 660 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PCDHA7Q9UN72 937 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMTNL1A8MU46 457 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BAG3O95817 575 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MMP10P09238 476 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TNNT1P13805 278 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RCAN1P53805 252 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STK38Q15208 465 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RGS22Q8NE09 1264 aa27.77■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ORC4O43929 436 aa27.76■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARID5BQ14865 1188 aa27.76■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SP8Q8IXZ3 490 aa27.76■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SRGNP10124 158 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMC4Q7Z404 712 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LINC00301Q8NCQ3 95 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WASF1Q92558 559 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRRC37AA6NMS7 1700 aa27.76■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NMT2O60551 498 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGSF3O75054 1194 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OLFM4Q6UX06 510 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NBPF11Q86T75 865 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDCL2Q8N4E4 241 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 POLR3EQ9NVU0 708 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RIMBP2O15034 1052 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LDHCP07864 332 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDE4BQ07343 736 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MFSD14BQ5SR56 506 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADALQ6DHV7 355 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CATIPQ7Z7H3 387 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FLAD1Q8NFF5 587 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PARP3Q9Y6F1 533 aa27.75■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A1W2PQ27 194 aa27.74■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A1W2PQ64 194 aa27.74■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A0A1W2PQD8 194 aa27.74■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa27.74■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LTBP1Q14766 1721 aa27.74■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NRXN2Q9P2S2 1712 aa27.74■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BECN2A8MW95 431 aa27.73■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NEMFO60524 1076 aa27.73■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NPR1P16066 1061 aa27.73■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 YEATS4O95619 227 aa27.72■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BTDP43251 543 aa27.72■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPP4CP60510 307 aa27.72■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SYCP1Q15431 976 aa27.72■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CEP57L1Q8IYX8 460 aa27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms