RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 PDE3AQ14432 1141 aa25.44■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 SH3D19Q5HYK7 790 aa25.44■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.44■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 WDR18Q9BV38 432 aa25.44■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 TMOD4Q9NZQ9 345 aa25.44■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa25.43■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.43■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 MYH7P12883 1935 aa25.43■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 PDE6AP16499 860 aa25.42■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 MTFR1Q15390 333 aa25.42■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 GINM1Q9NU53 330 aa25.42■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 BACE1P56817 501 aa25.41■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 TTC6Q86TZ1 520 aa25.41■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 SERPINB13Q9UIV8 391 aa25.41■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.4■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 USP17L10C9JJH3 530 aa25.4■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 UBXN2AP68543 259 aa25.4■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 FAM110CQ1W6H9 321 aa25.4■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.4■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.4■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 MYH8P13535 1937 aa25.39■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 C19orf81C9J6K1 198 aa25.39■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 GH2P01242 217 aa25.39■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 FLT3LGP49771 235 aa25.39■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 SLAIN1Q8ND83 568 aa25.39■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 COA7Q96BR5 231 aa25.39■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
PPP4C-211ENST00000567642 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 BRCA2P51587 3418 aa25.38■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 ADCY3O60266 1144 aa25.38■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 EHD4Q9H223 541 aa25.38■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.38■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 CCL5P13501 91 aa25.37■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 TATDN1Q6P1N9 297 aa25.37■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.37■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 ELNP15502 786 aa25.36■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 ATP5JP18859 108 aa25.36■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 PLCD1P51178 756 aa25.36■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 RNF208Q9H0X6 261 aa25.36■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.35■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.35■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 ABCB5Q2M3G0 1257 aa25.35■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 USP17L2Q6R6M4 530 aa25.35■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 LCORLQ8N3X6 602 aa25.35■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 FEZ1Q99689 392 aa25.35■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 MCM9Q9NXL9 1143 aa25.35■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.34■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.34■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 HAUS7Q99871 368 aa25.34■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 CABP5Q9NP86 173 aa25.34■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 IRF5Q13568 498 aa25.33■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.33■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 ARMT1Q9H993 441 aa25.33■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.33■■□□□ 1.65
PPP4C-211ENST00000567642 INHAP05111 366 aa25.32■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 GJB1P08034 283 aa25.32■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 SHMT1P34896 483 aa25.32■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 ADD2P35612 726 aa25.32■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 HERVK_113P62684 666 aa25.32■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 PXYLP1Q8TE99 480 aa25.32■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 UNC93B1Q9H1C4 597 aa25.32■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 PLXNB2O15031 1838 aa25.31■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 SHISA4Q96DD7 197 aa25.31■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.31■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 PEX10O60683 326 aa25.3■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 MBD4O95243 580 aa25.3■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 SLC34A2O95436 690 aa25.3■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 GJA8P48165 433 aa25.3■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 EVX2Q03828 476 aa25.3■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa25.3■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 CYP2D6P10635 497 aa25.29■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 ACER1Q8TDN7 264 aa25.29■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 PAGR1Q9BTK6 254 aa25.29■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 PRKAB2O43741 272 aa25.28■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 USP14P54578 494 aa25.28■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 GABPAQ06546 454 aa25.28■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 TXNRD2Q9NNW7 524 aa25.28■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 CHGBP05060 677 aa25.27■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 SEPT2Q15019 361 aa25.27■■□□□ 1.64
PPP4C-211ENST00000567642 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
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