RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	MTMR2	Q13614	643 aa		11.36	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		11.36	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		11.36	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	CABP5	Q9NP86	173 aa		11.36	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		11.36	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		11.36	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		11.36	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	DOCK2	Q92608	1830 aa		11.36	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	MYPN	Q86TC9	1320 aa		11.35	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	GH2	P01242	217 aa		11.35	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	GRK4	P32298	578 aa		11.35	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	UBE3C	Q15386	1083 aa		11.35	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		11.35	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		11.35	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	LCORL	Q8N3X6	602 aa		11.35	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		11.35	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	GPATCH3	Q96I76	525 aa		11.35	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	ARMT1	Q9H993	441 aa		11.35	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		11.35	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	PRKCZ	Q05513	592 aa		11.34	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		11.34	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		11.34	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		11.34	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		11.34	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	COA7	Q96BR5	231 aa		11.34	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		11.34	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	GABRQ	Q9UN88	632 aa		11.34	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		11.33	□□□□□ -0.59
KIFC3-231	ENST00000567479	PRKAB2	O43741	272 aa		11.33	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	MBD4	O95243	580 aa		11.33	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	SHMT1	P34896	483 aa		11.33	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	FLT3LG	P49771	235 aa		11.33	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		11.33	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		11.33	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	DOCK1	Q14185	1865 aa		11.33	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	ADCY3	O60266	1144 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	USP14	P54578	494 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	UBXN2A	P68543	259 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	GABPA	Q06546	454 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	FEZ1	Q99689	392 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	SWAP70	Q9UH65	585 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		11.32	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	USP17L15	C9J2P7	530 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	USP17L12	C9JPN9	530 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	USP17L11	C9JVI0	530 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	USP17L21	D6R901	530 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	USP17L18	D6R9N7	530 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	USP17L22	D6RA61	530 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	USP17L19	D6RCP7	530 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	USP17L20	D6RJB6	530 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	CHGB	P05060	677 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP2D6	P10635	497 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	HERVK_113	P62684	666 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	USP17L24	Q0WX57	530 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	IRF5	Q13568	498 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	MTFR1	Q15390	333 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	C12orf60	Q5U649	245 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	CRBN	Q96SW2	442 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	ERC2	O15083	957 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	CCL5	P13501	91 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	GUCY1A2	P33402	732 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	EVX2	Q03828	476 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	SEPT2	Q15019	361 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	ACER1	Q8TDN7	264 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	C12orf42	Q96LP6	360 aa		11.3	□□□□□ -0.6
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC17	Q96LX7	622 aa		11.3	□□□□□ -0.6

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