RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566915.5

LPCAT2-208, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, human

TSL 1 (best)

Gene LPCAT2, Length 5,285 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPCAT2-208	ENST00000566915	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	ATP5J	P18859	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	EYA3	Q99504	573 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	NDUFAB1	O14561	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	ZNF202	O95125	648 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	APOBR	Q0VD83	1088 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	PAK1	Q13153	545 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	TSPYL6	Q8N831	410 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	GPATCH11	Q8N954	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	STX10	O60499	249 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	RASSF2	P50749	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	NAPA	P54920	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	ATP11A	P98196	1134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	RABGGTA	Q92696	567 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	GTF3C6	Q969F1	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	ADGRB2	O60241	1585 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	CPD	O75976	1380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	CUL4A	Q13619	759 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	PARP10	Q53GL7	1025 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	TNNI3K	Q59H18	835 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	GALNT17	Q6IS24	598 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	TRIM58	Q8NG06	486 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	SNRK	Q9NRH2	765 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	NWD1	Q149M9	1564 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	IKBKB	O14920	756 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	CMA1	P23946	247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	CCDC14	Q49A88	953 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	KIFAP3	Q92845	792 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	CNKSR1	Q969H4	720 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	ALDH1B1	P30837	517 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	CARD6	Q9BX69	1037 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	RNF14	Q9UBS8	474 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	PTPRU	Q92729	1446 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	USP31	Q70CQ4	1352 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915		A0A1B0GVL5	298 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	ZBTB22	O15209	634 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	PFKFB2	O60825	505 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LPCAT2-208	ENST00000566915	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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