RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.63■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 TBC1D12O60347 775 aa22.63■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 KDM4AO75164 1064 aa22.63■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 SHMT1P34896 483 aa22.63■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 IFFO2Q5TF58 517 aa22.63■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 RUFY3Q7L099 469 aa22.63■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.63■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.63■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 ESR2Q92731 530 aa22.63■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 HOOK2Q96ED9 719 aa22.63■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 RASA1P20936 1047 aa22.62■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.61■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 RPS6KB1P23443 525 aa22.61■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 MCM5P33992 734 aa22.61■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 NEK4P51957 841 aa22.61■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.61■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 DLK2Q6UY11 383 aa22.61■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.61■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.61■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.61■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 TSPY2A6NKD2 308 aa22.6■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 NT5C2P49902 561 aa22.6■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 MAP3K10Q02779 954 aa22.6■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.6■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 DCAF15Q66K64 600 aa22.6■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.6■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 CHST3Q7LGC8 479 aa22.6■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.6■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 TFAP4Q01664 338 aa22.59■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 CDCA5Q96FF9 252 aa22.59■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.59■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 PRC1O43663 620 aa22.59■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 TSPY3P0CV98 308 aa22.59■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 TSPY8P0CW00 308 aa22.59■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 ANTXR2P58335 489 aa22.59■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 CCDC17Q96LX7 622 aa22.58■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.58■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 AKR1B1P15121 316 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 MYH6P13533 1939 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.56■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 NF2P35240 595 aa22.56■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 IQCA1Q86XH1 822 aa22.56■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.56■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 TTC14Q96N46 770 aa22.56■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.56■■□□□ 1.2
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CTU2-204ENST00000564105 ST18O60284 1047 aa22.55■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 GDF11O95390 407 aa22.55■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
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CTU2-204ENST00000564105 Q6ZUG5 572 aa22.55■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 IL27Q8NEV9 243 aa22.55■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.55■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 PTPRFP10586 1907 aa22.55■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.55■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 FGD1P98174 961 aa22.55■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.55■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 TMEM87BQ96K49 555 aa22.55■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 MTA3Q9BTC8 594 aa22.55■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 FZD1Q9UP38 647 aa22.55■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 TRAF5O00463 557 aa22.54■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 PRKG1Q13976 671 aa22.54■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.54■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 TNKSO95271 1327 aa22.54■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 ERICH2A1L162 156 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 NMT2O60551 498 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 CAP2P40123 477 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 AK2P54819 239 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 CABP5Q9NP86 173 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.52■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.52■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.52■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
CTU2-204ENST00000564105 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CTU2-204ENST00000564105 GH2P01242 217 aa22.51■■□□□ 1.19
CTU2-204ENST00000564105 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
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