RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 OTOFQ9HC10 1997 aa22.09■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 AKR1B1P15121 316 aa22.09■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.09■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.08■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 CAP2P40123 477 aa22.08■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 MAP3K11Q16584 847 aa22.08■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.08■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.08■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.07■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 KDM4AO75164 1064 aa22.07■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 TFAP4Q01664 338 aa22.07■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRDNQ13061 729 aa22.07■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRT32Q14532 448 aa22.07■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 NCOA7Q8NI08 942 aa22.07■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.07■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRT23Q9C075 422 aa22.07■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 GH2P01242 217 aa22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANAPC15P60006 121 aa22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 MAP3K9P80192 1104 aa22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 ESR2Q92731 530 aa22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC17Q96LX7 622 aa22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 NEK1Q96PY6 1258 aa22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 DOCK1Q14185 1865 aa22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 TSPY2A6NKD2 308 aa22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 TSPY3P0CV98 308 aa22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 TSPY8P0CW00 308 aa22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 CPA1P15085 419 aa22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 GUCY1A2P33402 732 aa22.05■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 FKBP1BP68106 108 aa22.05■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 VGLL4Q14135 290 aa22.05■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.05■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 CHST3Q7LGC8 479 aa22.05■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.05■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 IL17RAQ96F46 866 aa22.05■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.05■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.05■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANTXR2P58335 489 aa22.04■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.04■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.04■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIF2CQ99661 725 aa22.04■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.04■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 CABP5Q9NP86 173 aa22.04■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 NMT2O60551 498 aa22.03■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 SEPT2Q15019 361 aa22.03■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.03■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.03■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 ASNSP08243 561 aa22.02■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.02■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.02■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.02■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.02■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.02■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 CSADQ9Y600 493 aa22.02■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.02■■□□□ 1.12
USP3-AS1-203ENST00000559737 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.01■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRC1O43663 620 aa22.01■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 PSMA5P28066 241 aa22.01■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 MCM5P33992 734 aa22.01■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.01■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 ELP3Q9H9T3 547 aa22.01■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.01■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM88BA6NKF7 163 aa22■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 PTPRAP18433 802 aa22■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 NT5C2P49902 561 aa22■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 HUNKP57058 714 aa22■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 SAPCD2Q86UD0 394 aa22■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 CEP95Q96GE4 821 aa22■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 LRRC2Q9BYS8 371 aa22■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 PICK1Q9NRD5 415 aa22■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 GINM1Q9NU53 330 aa22■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
USP3-AS1-203ENST00000559737 RPS6KB1P23443 525 aa21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms