RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557779.1

TMEM229B-208, Transcript of transmembrane protein 229B, humanhuman

TSL 2

Gene TMEM229B, Length 701 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229B-208ENST00000557779 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
TMEM229B-208ENST00000557779 ZNF532Q9HCE3 1301 aa29.32■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa29.32■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 MTMR2Q13614 643 aa29.32■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 BOLA2Q9H3K6 86 aa29.32■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 PAG1Q9NWQ8 432 aa29.32■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 MYH1P12882 1939 aa29.32■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 EN2P19622 333 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 BACE1P56817 501 aa29.31■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 PRKCZQ05513 592 aa29.31■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP29.31■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 TATDN1Q6P1N9 297 aa29.31■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 RAET1EQ8TD07 263 aa29.31■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 SERPINB13Q9UIV8 391 aa29.31■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 TTC6Q86TZ1 520 aa29.3■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa29.3■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 HAUS7Q99871 368 aa29.3■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 MYCP01106 439 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 FAM110CQ1W6H9 321 aa29.29■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 MGAMO43451 1857 aa29.28■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 GH2P01242 217 aa29.28■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 GRK4P32298 578 aa29.28■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 TMOD4Q9NZQ9 345 aa29.28■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 GABRQQ9UN88 632 aa29.28■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 C19orf81C9J6K1 198 aa29.27■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 USP17L10C9JJH3 530 aa29.27■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 PLCD1P51178 756 aa29.27■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 LCORLQ8N3X6 602 aa29.27■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 NAV1Q8NEY1 1877 aa29.27■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.28
TMEM229B-208ENST00000557779 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 ADD2P35612 726 aa29.26■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP29.25■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 SLAIN1Q8ND83 568 aa29.24■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 SDR42E1Q8WUS8 393 aa29.24■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 DCTPP1Q9H773 170 aa29.24■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 MCM9Q9NXL9 1143 aa29.24■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 SHMT1P34896 483 aa29.23■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 FLT3LGP49771 235 aa29.23■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 GABPAQ06546 454 aa29.23■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 MTFR1Q15390 333 aa29.23■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 SLFNL1Q499Z3 407 aa29.23■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 ARMT1Q9H993 441 aa29.23■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 EMILIN3Q9NT22 766 aa29.22■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 MBD4O95243 580 aa29.21■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 EVX2Q03828 476 aa29.21■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 IRF5Q13568 498 aa29.21■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 ABCB5Q2M3G0 1257 aa29.21■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 USP17L2Q6R6M4 530 aa29.21■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 ECHDC1Q9NTX5 307 aa29.21■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 MORF4L1Q9UBU8 362 aa29.21■■■□□ 2.27
TMEM229B-208ENST00000557779 ADCY3O60266 1144 aa29.2■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 COA7Q96BR5 231 aa29.2■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 CHGBP05060 677 aa29.19■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 RRP1P56182 461 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 RAB3GAP1Q15042 981 aa29.19■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 UBE3CQ15386 1083 aa29.19■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 C12orf42Q96LP6 360 aa29.19■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 FEZ1Q99689 392 aa29.19■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 PRKAB2O43741 272 aa29.18■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 CYP2D6P10635 497 aa29.18■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 CCL5P13501 91 aa29.18■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 HERVK_113P62684 666 aa29.18■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 UBXN2AP68543 259 aa29.18■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 CABP5Q9NP86 173 aa29.18■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa29.18■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa29.18■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa29.17■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 PXYLP1Q8TE99 480 aa29.17■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa29.17■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 ELNP15502 786 aa29.16■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 GUCY1A2P33402 732 aa29.16■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 ACER1Q8TDN7 264 aa29.16■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 SHISA4Q96DD7 197 aa29.16■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 GPATCH3Q96I76 525 aa29.16■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 USP14P54578 494 aa29.15■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 TXNRD2Q9NNW7 524 aa29.15■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 TAOK2Q9UL54 1235 aa29.15■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 MYH7P12883 1935 aa29.14■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 GJB1P08034 283 aa29.14■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 SEPT2Q15019 361 aa29.14■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 TSHZ3Q63HK5 1081 aa29.14■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 SLC44A5Q8NCS7 719 aa29.14■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 NKX2-3Q8TAU0 364 aa29.14■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
TMEM229B-208ENST00000557779 RNF208Q9H0X6 261 aa29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms