RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	SHMT1	P34896	483 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TPCN1-223	ENST00000552985	CAP1	Q01518	475 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TPCN1-223	ENST00000552985	SPP2	Q13103	211 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TPCN1-223	ENST00000552985	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TPCN1-223	ENST00000552985	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TPCN1-223	ENST00000552985	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TPCN1-223	ENST00000552985	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TPCN1-223	ENST00000552985	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	USP17L12	C9JPN9	530 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	USP17L21	D6R901	530 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	GH2	P01242	217 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	ASNS	P08243	561 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	DGKZ	Q13574	1117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	EVI5L	Q96CN4	794 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	PDE4A	P27815	886 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	HMGCS2	P54868	508 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	IFFO2	Q5TF58	517 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	C12orf60	Q5U649	245 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	CTR9	Q6PD62	1173 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	WDR18	Q9BV38	432 aa		13.51	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	TLR2	O60603	784 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	CYP2C8	P10632	490 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	MTMR2	Q13614	643 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	TREML2	Q5T2D2	321 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.5	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	FOXP2	O15409	715 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	SP3	Q02447	781 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	ABHD8	Q96I13	439 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM227B	Q96M60	508 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	GINM1	Q9NU53	330 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	CPA4	Q9UI42	421 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		13.49	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	CAPN15	O75808	1086 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	CDK8	P49336	464 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	BACE1	P56817	501 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	SEPT2	Q15019	361 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	C17orf99	Q6UX52	265 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	ACER1	Q8TDN7	264 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	RILPL2	Q969X0	211 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.48	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985		A0A0D9SFI3	127 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	USP17L10	C9JJH3	530 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	APP	P05067	770 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	AKR1B1	P15121	316 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	GNAT2	P19087	354 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	SBK1	Q52WX2	424 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	VPS53	Q5VIR6	699 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	ERO1A	Q96HE7	468 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	CABP5	Q9NP86	173 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		13.47	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	HTT	P42858	3142 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	CTGF	P29279	349 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	TDO2	P48775	406 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	TRIM17	Q9Y577	477 aa		13.46	□□□□□ -0.25
TPCN1-223	ENST00000552985	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TPCN1-223	ENST00000552985	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms